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利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录和染色质可接近性

2018年9月6日/生物谷BIOON/---不同细胞类型的基因组可能是相同的,但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成,而转录组指的是在某一特定条件下,细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。在RNA转录过程中,细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分。鉴于这种接近在不同细胞类型之间存在着变化,因此染色质可接近性有

2018-09-06

柳叶刀·血液学:基因测序降低输血风险 如何做到的?

  《柳叶刀 血液学》近日发布了一条论文消息,哈佛医学院和纽约血液中心的科学家们,成功开发出基于全基因组测序的血型分型全新算法——bloodTyper。对照耗时费力的传统测定方法,例如血清学测定法或单核苷酸多态性(SNP)测定法,bloodTyper血型分型的准确度超过90%,且可供在线使用,这将有利于输血前的血型配型,促进安全输血。大多数人都很熟悉 ABO血型、或Rh血型分型

2018-05-22

我国科学家完成小麦A基因测序和精细图谱绘制

  小麦是全球最重要的粮食作物,养活了世界上40%的人口,提供了人类所需热能和蛋白质的20%。我国是世界上小麦生产和消费大国,常年种植面积为2,400万公顷左右,年产量近1.3亿吨。生产上广泛种植的普通小麦是一个经两次自然杂交而形成的异源六倍体,含有A、B和D三个亚基因组,其基因组大(约17 Gb,是水稻基因组的40倍)而复杂,85%以上基因组DNA为重复序列,致使基因组测序研

2018-05-17

罗氏牵手迪安诊断,引入“全面基因测序分析服务”,共同推动中国肿瘤个体化诊疗进程

小编推荐会议:2018基因编辑与基因治疗国际研讨会罗氏公司(以下简称“罗氏”)4月27日宣布,罗氏及其控股公司Foundation Medicine, Inc.,已与迪安诊断技术集团股份有限公司(以下简称“迪安诊断”)签订了合作协议,将共同携手推动中国肿瘤个体化治疗进程。根据该合作协议,迪安诊断将成为Foundation Medicine肿瘤全面基因组测序分析技术在中国市场的独家合作伙伴,为肿瘤全

2018-05-02

Science:构建出真涡虫细胞类型转录图谱

2018年4月24日/生物谷BIOON/---真涡虫是一类相对简单的动物,具有不同寻常的生物学特征:成年真涡虫维持着其他有机体仅在胚胎中短暂存在的发育信息和祖细胞(progenitor cell)。真涡虫获得人们的大量研究,部分原因在于它们具有再生丢失的或受损的身体部位的独特能力。图片来自Christopher Fincher/Whitehead Institute。在一项新的研究中,来自美国怀特

2018-04-24

转录学研究领域重要研究进展一览

转录组学,即在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科,近年来,科学家们在转录组学研究领域取得了多项研究成果,本文中,小编对相关重要研究进行整理,分享给大家!【1】Cell:基于高通量单细胞转录组测序小鼠全细胞图谱发表doi:10.1016/j.cell.2018.02.001在国家自然科学基金项目等资助下,近日,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳

2018-03-27

单个细胞转录测序成本降至1美分!《科学》期刊发布重磅SPLit-seq技术

 许多疾病,例如阿尔兹海默病和帕金森病,都源于某些类型细胞的功能障碍。对这些类型的细胞进行深度分析、发掘致病基因,将有助于了解疾病的病因和进展情况,进而帮助开发出相应的治疗方法。通过单细胞RNA测序技术对细胞进行分类是现阶段重要的研究方向,但是现有方法价格昂贵,且需要专门的设备,严重阻碍了单细胞研究的广泛开展。近日,一项最新研究成果为单细胞测序技术带来了突破,有望将单个细胞的测序成本降至

2018-03-20

转录测序数据分析及案例实践班(第四期)

转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(Non-coding RNA)。现在主流的非编码RNA又包括:circRMA,microRNAs,及lncRNAs。转录组学是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和 空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。转录组测序(RNA-

2018-03-12

Cell:基于高通量单细胞转录测序小鼠全细胞图谱发表

 在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序技术绘制小鼠细胞图谱)为题,于2018年2月23日在生命科学国际顶尖期刊Cell(《细胞》)

2018-03-09

转录化学药物诱导型基因编辑和转录激活系统

 小编推荐会议:2018基因编辑与基因治疗研讨会生物学变化多受到高度动态的分子事件调控,为了更精确的理解并研究这些过程,应用条件性可诱导的技术手段是十分必要的。此前,得到广泛应用的药物诱导技术之一是通过配体结合激发雌激素受体蛋白(ER)从细胞质到细胞核的转运。在没有激素配体的情况下,ER与热激蛋白(hsp90)结合定位于细胞质中;一旦与配体结合,ER与hsp90解离,并转运到细胞核中。类

2018-03-07