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统计学家提醒警惕生物统计学软件误用导致研究错误

2013年10月24日讯 /生物谷BIOON/ --随着生物信息学软件和生物统计学软件的普及和飞速发展,生物学家掌握了越来越强大的数据处理工具,为生命科学发展和药物研发做出了重要贡献。然而随之而来的问题是随着种类众多的生物统计软件的问世,研究人员误用的风险也越来越高。近日哥伦比亚大学的教授Victoria Stodden表示对此担忧。在研发中,统计方法要随着实验方法的不同而作调整。

2013-10-25

Cell Reports:蛋白质折叠过程中关键作用因子的发现

蛋白质是细菌的分子结构单元和功能组件,和生物代谢过程息息相关,为了完成正常的生理过程,蛋白质需要被折叠成三维的复杂立体结构形式,近日,来自德国马克思普朗科生物化学研究所(MPIB)的研究人员分析了在蛋白质折叠过程中的一个关键因子,即分子伴侣DnaK,研究者Ulrich Hartl表示,理解蛋白质折叠过程中的分子机制,尤其是折叠错误,对于了解很多疾病发病的分子机制很有必要。

2012-11-18

折叠蛋白针对性地杀死大肠杆菌

大肠杆菌的某些菌株产生杀灭竞争性大肠杆菌和其他微生物的蛋白质,英国纽卡斯尔大学研究人员最近发现了这些致命性蛋白中的一个蛋白的奇怪现象:即使删除蛋白质的毒性折叠部分,未折叠端仍然是致命的。这一发现可能帮助科学家找到了新的、更有针对性的方式来杀死抗生素耐受微生物。研究人员将在2月25日加利福尼亚圣地亚哥举行的第五十六届生物物理学会年会上报告人他们的结果。

2012-02-28

EMBO:致病性蛋白质错误折叠背后的关键控制元件

纳米技术的金标准是天然蛋质。这些生物分子纳米机制,如氨基酸肽链打造出的大分子,能够折叠成令人眼花缭乱的各种形状和形式,这使它们能够执行同样令人眼花缭乱的多种基本生活功能。因为蛋白质折叠实际上与所有生物系统实际上一样重要,这一过程背后的机制仍然是一个谜。

2012-11-18

Nature:测序技术解码DNA折叠方式

染色体DNA包含着所有有机体的信息蓝图,人类有23对染色体,可以在人体发育的不同阶段知道基因如何来调节。尽管科学家们发明出了理解DNA一维结构的方法,但是截至到现在,对于DNA各个不同部分在细胞核中是如何折叠的却并不清楚。近日,来自路德维希癌症研究所的研究人员运用一种强大的DNA测序方法,研究了细胞核染色体中DNA的三维折叠结构,分析了DNA基本的折叠原则以及在基因调节中扮演的角色。

2012-11-18

PLoS ONE:肌萎缩侧索硬化症患者蛋白错误折叠的新机制

2013年5月12日讯 /生物谷BIOON/--蛋白质在人体内扮演着重要的角色,特别是神经蛋白,其在维持适当的脑功能中发挥关键作用。 脑部疾病如肌萎缩侧索硬化症(ALS),阿尔茨海默氏症,帕金森氏被称为“缠绕疾病”,因为上述疾病的特点是错误折叠的蛋白缠绕、聚集在大脑中。 近日,科学家们发现一个不寻常的氨基酸--BMAA能插入到神经蛋白中,使神经蛋白发生错误折叠和聚合。

2013-09-26

Cell:关键酶对修复DNA复制错误至关重要

近日,来自爱丁堡大学的研究者发现了一种新的酶,这种酶可以修复哺乳动物DNA复制过程中最常见的错误。这种错误是DNA序列和其夹杂的个别RNA融合体的错误,研究者发现这种错误在每个细胞中至少发生超过100万次,相关研究成果刊登在了近日的国际杂志Cell上。文章中,研究者揭示了RNase H2在DNA修复机制中扮演着中枢作用,对于保护人类基因组必不可少。

2012-11-18

Nature:蛋白折叠动态研究获进展

溶液中的化学反应的动力学可以由Hendrik Kramers在上个世纪40年代建立的一个理论得到最好的描述,该理论将爱因斯坦关于布朗运动的研究与速率理论联系了起来。 此前,人们一直没有可能测定Kramers的理论所预测的有关小分子的参数。

2013-10-31

远程医疗可减少农村急诊室的儿童用药错误

一项来自加州大学戴维斯分校的新研究发现,儿科专家提供的远程医疗会诊帮助减少了八家农村急诊室的用药错误情况。

2013-11-27

:新方法能实时观察蛋白折叠过程

蛋白的功能依赖于氨基酸肽链和这些肽链折叠的方式。尽管计算出前者相对而言比较容易,但是后者代表着一个大的挑战,甚至有一些严重的后果,因为很多疾病是由于蛋白折叠错误造成的。如今,美国宾夕法尼亚大学一个化学家小组设计出一种方法“实时”观察蛋白折叠,从而很可能导致人们从一般意义上更好地理解蛋白折叠和错误折叠

2012-11-18