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安捷伦基因组学系列讲座 —— 安捷伦RNA和DNA平行测序文库构建方案,一天当作两天用

利用DNA和RNA的平行靶向测序可以比对序列差异、验证基因融合,检测DNA突变的关联基因表达水平变化。利用SureSelect XT HS2 RNA建库试剂盒,结合之前推出的 XT HS2 DNA试剂盒就可以轻松实现DNA和RNA的平行建库,实现上述应用。 之前我们已经介绍过XT HS2 DNA建库方案,本期将要介绍的SureSelect XT HS2 RNA 试剂盒是安捷伦最新推出的一款链特异性,靶向富集的RNA文库构建试剂盒。该试剂盒针对低起始量的FFPE样品进行了优化,样品起始量可低至10ng;试剂盒提供384对双端样本标签,接头序列中引入了分子标签,极大降低了测序中标签跳跃问题, 在去除Duplication时更准确;该试剂盒对整体建库流程进行了优化,建库时间缩短至11个小时。SureSelect XT HS2 RNA与SureSelect XT HS2 DNA采用同一建库流程,两款试剂盒的配套使用可以实现DNA和RNA的平行建库。

2020-11-30 课时:33分钟

IDT Alt-R 基因编辑系统:创新驱动的一站式解决方案

CRISPR基因编辑技术的飞速发展,为功能基因组学的研究人员提供了解码基因功能的利器。本次直播会聚焦于IDT在CRISPR基因编辑领域里的最新研究进展,从引导RNA的形式选择,内切酶功能的优化以及同源介导重组HDR优化这3个层面具体阐述如何利用IDT提供的创新型Alt-R CRISPR基因编辑工具在细胞系中取得高效精准的基因敲除和敲入。同时,我们也会向大家介绍IDT新近发布的HDR模板设计工具,这一工具集成了IDT在模板设计方面积累的大量经验,可以根据具体的实验目的给出模板序列的优化方

2021-03-18 课时:60分钟

IDT Alt-R 基因编辑系统:创新驱动的一站式解决方案

CRISPR基因编辑技术的飞速发展,为功能基因组学的研究人员提供了解码基因功能的利器。本次直播会聚焦于IDT在CRISPR基因编辑领域里的最新研究进展,从引导RNA的形式选择,内切酶功能的优化以及同源介导重组HDR优化这3个层面具体阐述如何利用IDT提供的创新型Alt-R CRISPR基因编辑工具在细胞系中取得高效精准的基因敲除和敲入。同时,我们也会向大家介绍IDT新近发布的HDR模板设计工具,这一工具集成了IDT在模板设计方面积累的大量经验,可以根据具体的实验目的给出模板序列的优化方案。

2021-03-18 课时:60分钟

IDT Alt-R 基因编辑系统:创新驱动的一站式解决方案

CRISPR基因编辑技术的飞速发展,为功能基因组学的研究人员提供了解码基因功能的利器。本次直播会聚焦于IDT在CRISPR基因编辑领域里的最新研究进展,从引导RNA的形式选择,内切酶功能的优化以及同源介导重组HDR优化这3个层面具体阐述如何利用IDT提供的创新型Alt-R CRISPR基因编辑工具在细胞系中取得高效精准的基因敲除和敲入。同时,我们也会向大家介绍IDT新近发布的HDR模板设计工具,这一工具集成了IDT在模板设计方面积累的大量经验,可以根据具体的实验目的给出模板序列的优化方案。

2021-03-18 课时:60分钟

IDT Alt-R 基因编辑系统:创新驱动的一站式解决方案

CRISPR基因编辑技术的飞速发展,为功能基因组学的研究人员提供了解码基因功能的利器。本次直播会聚焦于IDT在CRISPR基因编辑领域里的最新研究进展,从引导RNA的形式选择,内切酶功能的优化以及同源介导重组HDR优化这3个层面具体阐述如何利用IDT提供的创新型Alt-R CRISPR基因编辑工具在细胞系中取得高效精准的基因敲除和敲入。同时,我们也会向大家介绍IDT新近发布的HDR模板设计工具,这一工具集成了IDT在模板设计方面积累的大量经验,可以根据具体的实验目的给出模板序列的优化方案。

2021-03-18 课时:60分钟

IDT Alt-R 基因编辑系统:创新驱动的一站式解决方案

CRISPR基因编辑技术的飞速发展,为功能基因组学的研究人员提供了解码基因功能的利器。本次直播会聚焦于IDT在CRISPR基因编辑领域里的最新研究进展,从引导RNA的形式选择,内切酶功能的优化以及同源介导重组HDR优化这3个层面具体阐述如何利用IDT提供的创新型Alt-R CRISPR基因编辑工具在细胞系中取得高效精准的基因敲除和敲入。同时,我们也会向大家介绍IDT新近发布的HDR模板设计工具,这一工具集成了IDT在模板设计方面积累的大量经验,可以根据具体的实验目的给出模板序列的优化方案。

2021-03-20 课时:60分钟

纳米孔测序揭示的新冠基因组突变及其临床意义

四川大学华西医院实验医学科报导了一种具有重要临床意义的新冠病毒Nsp1(Δ500-532)突变株,并从分子病毒、分子流行病和临床表现角度阐述了该突变株的特征。研究成果发表在《Cell Host & Microbe》(IF 15.7)。我们邀请到本文通讯作者:四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室和实验医学科耿佳研究员为大家详细介绍研究团队利用纳米孔三代测序技术对来自于248位新冠感染者的310个临床样本进行病毒全基因组测序,结合临床数据对检测到的突变株进行分子流行病学分析和表征。

2021-03-22 课时:61分钟

基因指导心血管药物的临床应用

在高度多因素的疾病(如高血压)中,多个遗传因素会对患者对疗法的反应产生重大影响,药物基因组学检测在心血管疾病的治疗中具有重要意义。药物基因组学检测往往涉及多个基因位点,而核酸质谱技术在该领域的研究和转化应用有着重大优势。 哈医大附属第一医院的梁慧博士将给我们介绍核酸质谱这一多重基因检测技术的技术原理和基因指导心血管用药的临床实际案例,以及她们基于核酸质谱平台开展的科研工作。

2021-04-12 课时:54分钟

纳米孔测序与中国人群基因组结构变异研究

纳米孔测序无需扩增,可直接在信号内识别甲基化信息,无需额外化学转换。长读长能够以高再现性和低偏好性直接检测基因组甲基化,并准确进行甲基化单倍型分型。结构变异(SVs)是指长度超过50bp的插入、缺失、倒位和移位的基因组序列重组,研究表明结构变异与健康、表型、常见或罕见人类疾病均有关联。对大型结构变异的研究往往受限于传统短读长技术固有的读长长度。 中国的汉族是世界上最大的民族,中心眼科学国家重点实验室谢志团队利用纳米孔超高通量测序平台PromethION,完成了405名中国汉族人群规模的纳米孔长读长结构变异分析,对中国人群基因组中由结构变异引起的多样性及复杂性遗传变异进行研究意义重大,研究成果发表在预印网站《BioRxiv》。DOI: https://doi.org/10.1101/2021.02.09.430378

2021-04-19 课时:76分钟

黄连基因组揭示了小檗碱多样性

中国有1000多种药用植物,因与国人健康息息相关。千种药用植物基因组研究计划旨在3-5年内收集整理并测序完成1000种重要的药用植物基因组,并构建一个全球最大的药用植物..

2021-09-10 课时:67分钟