Science:新型人工智能工具模拟蛋白质动力学,助力药物发现和蛋白质研究
BioEmu将超过200毫秒的分子动力学模拟与实验数据相结合,以接近实验的精度预测结构集合和热力学性质。
Science:利用人工智能揭示蛋白质稳定性规则,有望推进蛋白质工程变革
蛋白质稳定性遵循的规则比之前认为的更简单,这一证实可以大幅减少蛋白质设计的试错阶段,为开发具有医疗或工业应用的蛋白质(如更环保的催化剂或更持久的药物)节省大量时间和精力。
攻克“不可成药”,David Baker团队中国博后利用AI从头设计蛋白,靶向内在无序蛋白,解锁治疗靶点
这两项研究中,研究团队采用了两种互补的设计策略,这两种策略基于氨基酸序列,而无需蛋白结构信息,因此,有助于在大量新的治疗靶点上实现高度通用的药物发现。
Nat Chem Biol:发现tau蛋白和β淀粉样蛋白之间的通信可以减轻阿尔茨海默病的毒性
在这项研究中,团队结合了精密分析技术,包括光谱学、质谱分析、等温滴定量热法和核磁共振,与基于细胞的毒性检测,全面分析了tau-Aβ相互作用的结构、热力学和功能特性。
Cell子刊:赖仞团队揭示高脂饮食通过肠道细菌促进血栓形成的新机制
该研究证实,高脂饮食会通过促进肠道细菌多形拟杆菌的定制来增加循环系统中棕榈酸水平,从而加剧血栓形成,而橙皮苷可预防由棕榈酸引起的血栓形成。
Nature:深度视觉蛋白质组学揭示肝脏疾病中的蛋白质毒性新机制
本文研究通过深度视觉蛋白质组学技术为AATD的病理机制提供了全新的视角,相关研究结果不仅揭示了蛋白质毒性的分子基础,还为未来开发新型治疗策略提供了潜在的靶点。
会“变身”的弹性蛋白纳米粒,打破细胞递送壁垒,蛋白、核酸一网打尽
研究表明,ENTER系统不仅能在体外将蛋白质、siRNA、mRNA和基因编辑工具高效、低毒地递送进多种细胞类型,包括关键的原代细胞,甚至在活体动物(小鼠肺部)中也成功实现了基因编辑!
Nature系列综述:乔治·丘奇绘制 AI 蛋白质设计路线图,逐步指导利用AI工具设计蛋白质
该综述的核心是提供一个全面且可操作的蛋白质设计路线图,逐步指导如何将最先进的 AI 工具整合到蛋白质设计工作流程中,包括结构与功能预测工具以及用于从头设计的生成式模型。
David Baker团队开发新型AI蛋白设计模型——LigandMPNN,实现原子上下文条件蛋白序列设计
研究团队开发了一种新型深度学习方法——LigandMPNN,该方法明确地对生物分子系统中的所有非蛋白质成分进行了建模。
Cell子刊:FGF21是一种长寿激素,可促进饮食诱导的肥胖小鼠的长寿
结果表明,脂肪组织是 FGF21 发挥有益作用的核心部位,并且表明其有可能通过在饮食压力下促进更健康的代谢状况来治疗代谢综合征和年龄相关疾病,从而延长健康寿命和寿命。