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Nature子刊:浙大团队揭示肠道细菌调控表观转录修饰促进结直肠癌转移机制

结直肠癌是常见恶性肿瘤之一,是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展,但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想,我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。近年来,随着宏基因组测序等研究手段的不断进展,人们发现肠道菌群能广泛影响宿主细胞的生理和病理功能,并揭示了多种微环境细菌能够参与结直肠癌

2022-03-15

BMC Plant Biology:小粒咖啡种质资源全基因测序解析研究获进展

   小粒咖啡(Coffea arabica)隶属于茜草科(Rubiaceae),是多年生的重要经济作物。随着特色咖啡需求增加,开发市场需求高的咖啡品种颇为重要。埃塞俄比亚作为小粒咖啡基因库的主要来源,其种质资源具有颇高的价值,可用于培养优良性状的品种。基因组重测序可以促进分子育种,且通过重测序分析产生的标记有助于推进传统作物育

2022-03-03

Nature Immunology: 转录因子家族对静息和活化T细胞表观基因的分级调控

T细胞激活是适应性免疫反应中的一个关键早期事件,受到精细的转录调控

2022-01-22

CANCER DISCOV:通过基因转录组分析揭秘转移性乳腺癌(MBC)的复发过程!

近来Philippe Aftimos教授及其团队针对乳腺癌基因展开了相关研究,旨在通过对原发肿瘤和早期转移瘤进行多组学分析,研究转移性乳腺癌(MBC)的复发过程。

2022-01-18

中山大学生命科学学院RNA学团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库

中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库,系统鉴定RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚合酶 III 转录的 ncRNAs 转录组数据。Pol3Base 的

2022-01-02

Nat Commun:全基因测序揭示结核分枝杆菌的抗生素“预抗性”特征!

2021年12月19日 讯 /生物谷BIOON/ --细菌全基因组测序的最新进展让研究人员成功绘制出了结核分枝杆菌抗生素耐药基因组特征的完整目录;近日,一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“Genomic signatures of pre-resistance in Mycobacterium tuberculosis”的研究

2021-12-20

Current Biology:全寄生植物盾片蛇菰的线粒体基因结构、复制机制与转录模式研究方面取得重要进展

寄生植物通过吸器从寄主植物获得生存所需的营养,是一种独特的生活习性,该习性在被子植物中独立起源了十二次,产生了4500多种寄生植物。寄生植物通常表现出营养器官退化、叶绿素部分或全部丢失、基因组特化等特征。研究寄生植物的基因组特征有助于我们理解其寄生习性的进化机制。植物细胞内有三大基因组,即核基因组、质体基因组和线粒体基因组。目前寄生植物的基因组研究主要聚焦于

2021-12-22

单细胞转录研究难治性多发性骨髓瘤亚克隆特异性微环境影响和药物反应

随着时间的推移,几乎所有的多发性骨髓瘤患者对治疗都会变得毫无反应。复发性/难治性多发性骨髓瘤(RRMM)伴随着骨髓瘤细胞的克隆性进化,并伴有异质性基因组畸变和骨髓微环境的深刻改变。然而,导致耐药性的分子机制仍然难以捉摸。

2021-12-09

BMJ:所有婴儿都应该在出生时进行基因测序吗?

近日,一篇发表在国际杂志BMJ上题为“Should all babies have their genome sequenced at birth?”的研究报告中,来自美国国立人类基因组研究所等机构的科学家们围绕这一话题开展了辩论。

2021-11-24

单细胞转录学揭示了Shp2在myc驱动的肝肿瘤细胞和微环境中的相反作用

myc驱动的肝脏肿瘤发生机制尚不清楚。该研究表明,在肝细胞特异性Ptpn11/ Shp2缺失的小鼠中,Mycdriven肝癌(HCC)显著加重。

2021-11-30