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Science:从宏基因组数据中分离出单个物种基因组序列

从由细菌、古细菌和病毒组装的错综复杂宏基因组DNA序列中,研究人员获得一种神秘的广古菌的整个基因组序列。图片来自Vaughn Iverson/华盛顿大学。 宏基因组学(metagenomics,译者注:也常译作环境基因组学)就是取样---一勺泥土或一杯海水---然后对样品内所有DNA进行测序。

2012-11-18

:发现牛肝菌新物种

牛肝菌(boletes)具有重要经济和生态价值,不少种是世界著名的野生食用菌,部分种是有名的毒菌,多数种是树木外生菌根菌。该科真菌形态多样、结构繁杂、分布广泛、平行进化与趋同进化并存,系统亲缘关系复杂,分类困难,食用物种和有毒物种容易混淆而导致毒菌中毒。

2013-01-20

ZJLS:张亚平等宝兴树蛙复合体物种系统进化研究获进展

扩散和地理隔离在物种形成中起着重要作用。高海拨环境下的两栖动物长期栖息于较为寒冷的气候条件下,自身活动性较差,而青藏高原东缘山区受高原隆起影响,地质结构极端复杂,这使得居于青藏高原东缘的宝兴树蛙成为研究进化和物种形成的良好材料。

2012-11-18

Nat Protoc:新技术可从多个物种分离脂滴

来自中科院生物物理研究所、中国科学院大学和杭州师范大学的研究人员《自然—实验技术》(Nature Protocols)杂志上发表了题为“Isolating lipid droplets from multiple species”的文章,描述了一种可从多个物种中分离出脂滴的实验技术方案。 文章的通讯作者是中科院生物物理研究所的刘平生(Pingsheng Liu)研究员。

2013-01-04

PhytoKeys:植物新物种的分子诊断

科学家命名新植物方法的重要改变在2012年1月1日见效,这个重要改变包括取消新物种描述或诊断必须用拉丁文的规定。 在植物学家和真菌学家如何证实一个特定物种确实是新物种方面,新规定使充分利用不断更新成为可能:现在,许多常规研究包括对容易扩增的短DNA区域测序,即使是来自旧物种的DNA。 只要具有科学名称的相关物种也测定了相同的DNA序列,这样的条码序列则可用于确认疑似新物种

2012-03-26

:熊蜂为了觅食而广泛地寻找物种丰富的花丛

一项研究发现,本地的熊蜂为了觅食而长距离地寻找物种丰富的花丛,而且提示这些蜂的觅食距离取决于花丛的多样性而非密度。Shalene Jha 和Claire Kremen使用一种种群遗传学方法研究了Bombus vosnesenskii这种熊蜂的觅食模式,这是一种濒危的本地授粉者。这组作者对加州8个研究区域的工蜂进行了取样,并根据它们的DNA的13个微卫星位点确定了这些个体所属的蜂群。

2012-12-26

PLoS ONE:研究发现多物种间蛋白质丰度整体分布规律

生命体的遗传稳定性在于基因组,功能多样性在于蛋白质组。蛋白质组是由若干蛋白质所构成的集合体,其构成原则即其丰度整体分布规律,属于重大理论问题。贺福初院士所领导的军事医学科学院放射与辐射医学研究所、北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室及复旦大学生物医学研究院科研团队近来在多物种间揭示了蛋白质丰度的整体分布与蛋白质的进化、结构和功能存在规律性的相关...

2012-03-27

PNAS:美发现不同的植物种类有相同的DNA编码

近日,密苏里大学发现,在多种植物基因组完全不同的区域中发现相同的DNA序列。Dmitry Korkin是计算机系的助理教授,也是该论文的主要作者。“之前没有人能够完成这样一规模的研究。”研究结果发表在PNAS杂志上。 当白宫科技政策办公室宣布了“大数据研究和发展倡议”后,对大量数据进行官方分析成为国家的重中之重。

2012-11-18

Cell:趋异进化揭示了不同物种间的基因组差异

这是一个基于古细菌、细菌和真核生物基因组tRNA组成的系统树(Credit: Image: Eva Novoa (IRB Barcelona)) Copyright ®版权归生物谷所有,若未得到Bioon授权,请勿转载。

2012-11-18

中科院华南植物园在南岭发现7个植物新物种

华南植物园物种多样性保育研究组25日对外宣布,经过该研究组历时4年多的调查,在南岭发现了7个新的植物物种

2014-04-29