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贺建奎:单细胞基因组学的兴起

上周在美国冷泉港(Cold Spring Harbor)参加了单细胞分析会议(single cell analysis), 这是一个非常令人激动的前沿学术会议,深深的体会到了单细胞基因组学的时代已经来临。 Cold Spring Harbor的会议是公认的高水准的会议,它有几个特点:首先,所做的报告都是最新的研究,组织方特别强调,希望介绍尚未发表的研究进展。

2013-03-20

Nature Communications:短花药野生稻基因组测序及分析

稻属是从事植物比较、进化和功能基因组学研究的理想系统。野生稻蕴含着宝贵的基因资源。为了更好地利用稻属的野生资源,美国亚利桑那大学的Rod Wing教授在2009年发起了国际稻属基因组计划(I-OMAP),旨在构建稻属所有物种的全基因组序列图谱,并在此基础上开展比较、进化和功能基因组学研究。

2013-03-18

Nature:测序技术走出实验室,进入"答"时代

2012年是测序技术高歌猛进的一年,技术日新月异、价格则一跌再跌。到了2013年,价格暴跌的进程开始放慢,然而2月20-23日参加AGBT会议的研究人员们并没有因此抱怨。目前,人基因组测序价格低至5000-10000美元,测序已经足够廉价而可靠,研究者无需再等待下一代测序仪。 近期的受益者有两个:继试管婴儿之后的胚胎筛选技术以及宏基因组医学。

2013-03-13

JID:利用外显子组测序鉴定出了一个新白化病基因

眼皮肤白化病(OCA)是一种具有遗传异质性的常染色体隐性遗传病,在全世界的流行率约为1/17000,人群携带率约1/65,为我国北方地区相对常见的单基因遗传病。该病表现为皮肤、毛发和眼的黑色素减少或完全缺失,通常伴有畏光、斜视、眼球震颤等,可导致视力低下或丧失,是导致先天性眼残疾的常见原因之一。目前,已明确的人类OCA的致病基因有非综合征性OCA 基因4个和综合征性OCA 基因13个。

2013-03-04

Genome Biol:深度测序揭示胃癌发病机制

2013年1月29日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,刊登在国际著名杂志Genome Biology上的一篇研究报告中,来自新加坡A*STAR研究所的研究人员发现了胃癌发生的四个过程,这对于研究胃癌,世界上常见的第二大致死性癌症,非常重要,每年有大约750,000患上胃癌,其中亚洲人占60%。

2013-01-29

2012年测序进展盘点 迈向千元基因组

2012年,测序方面的进展几乎每个星期都有重要成果发表在顶级期刊上,新产品也在不断涌现,让我们离千元基因组的目标又近了一步。同时,单细胞测序技术的快速发展也有望揭开更多细胞的秘密。有了这些新方法,宏基因组学、微生物组研究以及生殖细胞分析都硕果累累。以下是过去一年来测序方面的大事。

2015-03-26

Nat. Biotech.:首个家山羊的高质量参考基因组

OpGen公司今日宣布,通过利用ARGUS? Whole Genome Mapping System技术结合新一代测序技术(NGS),生成了首个家山羊(domestic goat)的高质量参考基因组。这一研究是由深圳华大基因研究院和中科院昆明动物研究所领导,相关成果发表在《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。

2012-12-26

Science:单细胞基因组测序

2012年12月22日讯 /生物谷BIOON/-- 基因组测序需要用PCR技术扩增出足够量的DNA片段。由于PCR扩增具有偏好型而且基因组具有大量的冗余,造成了基因组测序准确性不高。

2012-12-23

金斯瑞宣布与 AMDeC 合作 提供 DNA 测序服务

金斯瑞 (GenScript) 成为 AMDeC, LLC 的“厂商合作计划”的一员,巩固了双方的合作关系。这项计划通过为包括诸如纽约大学朗格尼医学中心 (NYU Langone Medical Center) 和威尔康奈尔医学院 (Weill Cornell Medical College) 等纽约市区域研究机构在内的集团成员提供厂商折扣价,将学术考察人员与商业实体联合到一起。

2012-12-12

Nat. Biotechnol.:新基因组测序方法能够在单细胞水平上分析基因表达谱

生物学家和遗传学家长期以来想要在单个细胞水平上分析基因表达谱,但是技术限制一直使得它不能成为现实。 根据2012年7月22日在线发表在Nature Biotechnology期刊上的一项研究,研究人员第一次证实一种新的被称作Smart-Seq的基因组测序方法能够帮助科学家们对临床上重要性的单个细胞进行深入分析。Smart-Seq可能有着很多方面的应用,包括帮助科学家们更好地理解肿瘤产生的复杂性。

2012-11-19