Nature:单细胞多组学研究揭示唐氏综合征儿童易患白血病的原因
这项单细胞多组学研究为唐氏综合征胎儿造血提供了高分辨率分子图谱,并表明唐氏综合征患者细胞基因组中存在显著的调节重构,从而导致他们易患白血病等血液学疾病。
2024-10-03
Nat Methods:瞿昆/黎斌/陈发来合作系统性评估单细胞多组学分析算法
结果显示,在蛋白质丰度预测方面,totalVI 和 scArches 表现最为优异;在染色质可及性预测中,LS_Lab 算法排名领先。
2024-10-02
Science:在怀孕期间和大量出血后,逆转录转座子激活造血干细胞,从而促进血细胞产生
研究发现,逆转录转座子和干扰素除了是避免贫血的必要条件外,还能在怀孕期间激活人类造血干细胞。
2024-10-28
Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
2024-10-03
Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。
2024-09-27
干细胞、类器官与表观遗传学的交响曲!Nat Neurosci:科学家构建单细胞表观基因组图谱,揭示调控细胞命运的关键“开关”
本研究中构建的人类神经类器官发育的单细胞表观基因组图谱,为深入了解人类细胞命运选择提供了宝贵的参考蓝本。
2024-07-22
单细胞数据的双刃剑!Cell:新研究指出人类scRNA-seq 数据集存在隐私泄露风险,应加强保护
利用不同实验室生成的数据,甚至用不同方法处理的数据,然后用它来将完全不同的匿名数据集中的个体关联起来,这种能力相当惊人,而且凸显了单细胞数据的真正隐私问题。
2024-10-24
张泽民课题组揭示跨组织多细胞协同模式及其在肿瘤中的重塑
该研究聚焦于组织层面的多细胞协同模式,创新性地提出了 “跨组织细胞模块(cellular module,CM)” 的概念,并开发了一套计算框架CoVarNet来识别细胞模块。
2025-06-01
Cell Rep:刘行/姚雪彪/王志凯合作揭示细胞更新转录调控新机制
该研究发现了书签标识因子FOXA1在细胞有丝分裂期过程中DNA结合模式转变的磷酸化调控机制,以及FOXA1转录凝聚体的形成与功能发挥的分子基础。
2024-09-22