利用单细胞拉曼光谱研究土壤解磷微生物取得进展
磷是一种至关重要但不可再生的资源。磷肥是作物生长必需三大营养元素（氮、磷、钾）之一，但磷矿是有限资源，据估计，以目前的磷矿储备，大概还能继续开采100年，因此，磷又被称为“正在消失的元素”。随着长期大量的磷肥施用，土壤中积累了大量固定态磷，大大降低了磷素的生物有效性，加剧了磷资源短缺的问题，对土壤固定态磷的活化成为未来发展可持续农业和磷肥利用的重要战略。微生物是土壤元素循环的发动机，解磷微生物可以
清华李梢组在Cell子刊首次解析胃炎癌转化单细胞网络，发现胃癌极早期标志物
Nat Methods：开发出一种新的基因组学工具ECCITE-seq，可扩展多模式单细胞分析
2019年5月10日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国纽约基因组中心的研究人员开发出一种称为ECCITE-seq的新技术，它允许科学家们对来自单细胞的多种信息模式进行高通量测量。相关研究结果发表在2019年5月的Nature Methods期刊上，论文标题为“Multiplexed detection of proteins, transcriptomes, clonotype
Cell：利用uliCUT&RUN方法在单细胞和单个胚胎中构建染色质上的蛋白结合图谱
2019年4月24日讯/生物谷BIOON/---在一项新的突破性研究中，来自美国匹兹堡大学和马萨诸塞大学医学院的研究人员对一种称为CUT&RUN（cleavage under targets and release using nuclease）的方法进行改进，使得在使用少量细胞（包括单细胞和单个植入前胚胎）的情形下，它适合用来研究转录因子和其他的DNA结合蛋白在染色质上的占据情况。相关研
《Nature》报道T细胞功能调控的关键转录因子
T细胞是适应性免疫系统的主要组成部分， 它们在病菌感染中被功能活化， 参与宿主防御， 但是遇到自身抗原或者在慢性感染和肿瘤微环境中， 它们会发生命运改变， 进入功能失能命运， 但是调控T细胞功能失能的分子机制会不清楚。本研究通过转录组及表观组学手段，发现功能缺陷的T细胞 [Dysfunctional T cell]， 包括免疫耐受T细胞 [Tolerant T cell] 和慢性感染和肿瘤微环境导
研究揭示干细胞分化关键转录因子
近期，国际学术期刊《细胞-干细胞》（Cell Stem Cell）在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学科研人员合作的干细胞分化的基因调控网络建模成果。这一成果提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画转录因子和调控元件结合调控下游基因表达的数学模型，构建了描绘细胞状态转化的染色质调控网络，通过网络分析鉴定出TFAP2C和p63分别为表面外胚层起始和角质形成细胞成熟的关键因
Nature：清华大学江鹏课题组揭示癌细胞通过p53调节氨代谢机制
2019年3月11日讯/生物谷BIOON/---癌细胞表现出改变的和通常增加的代谢过程来满足它们的较高的生物能量需求。在这些条件下，氨是伴随着代谢加工的增加而产生的。然而，人们尚不清楚肿瘤细胞如何处理过量的氨以及氨的累积可能导致的结果。在一项新的研究中，中国清华大学生命学院的江鹏（Peng Jiang）课题组报道了作为人类肿瘤中最常发生突变的肿瘤抑制基因，p53通过抑制尿素循环来调节氨代谢。通过对
效应性Treg细胞分化的转录调控研究中取得进展
调节性T细胞(Treg)是具有免疫抑制功能的T细胞，其主要的功能是抑制效应T细胞介导的免疫反应及维持机体的免疫耐受。效应性Treg只占次级淋巴器官和外周循环Treg细胞的较少一部分，大多数分布于各种组织脏器，效应性Treg是一群已经接受过抗原刺激、活化程度比较高且具有较强的免疫抑制功能的Treg细胞，这群细胞能够快速迁移进入发生免疫反应的部位，发挥免疫抑制的功能，防止T细胞介导的免疫反
Nat Commun：揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
2019年2月12日 讯 /生物谷BIOON/ --转录因子（TFs）是一种能调节基因表达的特殊蛋白，其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达；我们都知道，转录因子不仅能结合特殊的DNA序列，还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力，然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结合特殊位点时，人类机体中超过1500种转录因子的的效
Cell：科学家鉴别出维持细胞基因组完整性的新型DNA修复机制
2019年3月2日 讯 /生物谷BIOON/ --日前，一项刊登在国际杂志Cell上的研究报告中，来自范德堡大学的科学家们通过研究鉴别出了保持基因组完整性的新型DNA修复机制。研究者表示，这种机制是由一种名为HMCES的蛋白质所开启的，HMCES是此前研究者所鉴别出的200多种蛋白质家族的一种，这些蛋白质属于特殊分子机器的一员，其能在细胞分裂时帮助DNA进行复制。其中有些蛋白质是用于与DNA复制相