单细胞多组学技术揭示三维基因组与基因表达的关系
在高等真核生物中,基因组在细胞核内的三维空间构象对细胞功能至关重要。例如,增强子常常通过三维空间相互作用对远端目的基因的转录活性起调控作用
单细胞转录组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式
这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角
Cell:世界首套单细胞分辨率的猕猴大脑皮层细胞空间分布图谱发布
该研究产生了较为完整的世界首套猕猴全脑皮层的单细胞以及空间转录组数据,为后续的相关研究提供了重要的数据资源库,现已实现公开共享。
Cancer Cell:新型单细胞RNA测序研究有望揭示人类胃腺癌的发病机制及潜在的治疗性靶点
来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心等机构的科学家们通过研究深入理解了胃癌进展过程中肿瘤微环境的演变机制,本文的研究亮点包括揭示了多细胞群体和患者临床治疗结果之间的关联,并发现了一种潜在的新型治疗靶点。
Nature Cancer:汪希鹏/张泽民/李子逸等绘制卵巢癌多组织单细胞分辨率图谱
该研究指出腹水中记忆T细胞对肿瘤原发灶及网膜转移灶免疫微环境的关键重塑作用,并揭示了肿瘤组织和腹水中巨噬细胞功能表型和发育起源的异质性,为深入理解卵巢癌进展中恶性腹水的关键作用以及探索靶向肿瘤腹水的免
第六届单细胞多组学峰会嘉宾日程公布,20+大咖技术分享,800+业界同行9月共聚魔都
全议程首发!第六届单细胞多组学峰会嘉宾日程公布,20+大咖技术分享,800+业界同行9月共聚魔都
我国科学家构建出猕猴大脑皮层单细胞空间分布图谱
在一项新的研究中,来自中国多家研究机构的研究人员利用自主研发的空间转录组测序技术Stereo-seq以及snRNA-seq技术,绘制了猕猴大脑皮层细胞类型分类图谱,揭示了细胞类型组成与灵长类动物各个脑
Advanced Science:韩敬东团队开发转录组数据空间重构新算法
该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录
脂肪酸氧化是细胞对DNA损伤的反应的重要参与者,支持DNA修复和基因组稳定
细胞会遇到各种类型的DNA损伤。在这些威胁下,细胞促进一种协调良好的信号反应,称为DNA损伤反应(DDR)。DNA修复是DDR的重要组成部分之一。
新研究揭示逆转录转座子劫持宿主细胞的修复机制形成环状DNA
和病毒一样,一种有点寄生的称为逆转录转座子(retrotransposon)的DNA序列被发现借用细胞自身的机制来实现它本身的目标。