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《Cell》:单细胞组蛋白修饰模型展示表观遗传多样性随着衰老而增加

染色质修饰包括组蛋白转录后修饰,组蛋白多样性。连同DNA一起调控表观遗传表型。虽然染色质修饰在多种生理学过程和人类疾病中都有重要的意义,但是由于此前存在的技术检测通道有限,无法同时检测各种免疫细胞亚群特异性marker和各种染色质修饰。因此在人类免疫细胞中进行染色质研究具有挑战性。近期出现的一个技术突破——质谱流式技术,可以在少量细胞甚至是单细胞中进行四十种以上参数采集,可以完美应对这一挑战。斯坦

2018-06-05

Cell:基于高通量单细胞转录测序小鼠全细胞图谱发表

 在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序技术绘制小鼠细胞图谱)为题,于2018年2月23日在生命科学国际顶尖期刊Cell(《细胞》)

2018-03-09

Cell Stem Cell:利用CRISPR修饰表观基因产生诱导性多能干细胞

小编推荐会议:2018基因编辑与基因治疗研讨会2018年1月31日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国斯坦福大学、格拉斯通研究所和中国清华大学的研究人员报道,一种能够激活而不是切割DNA的CRISPR形式能够将胚胎小鼠细胞转化为诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cell, ipsC)。相关研究结果于2018年1月18日在线发表在Cell Stem

2018-01-31

科学家揭示整合单细胞和群体细胞转录数据推断细胞分化时间的作用

 近日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)马普计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组,中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组,与清华大学沈沁研究组合作发表的论文,以Inference of differentiation time for single cell transcriptomes using cell population reference data为题,在线发表

2017-12-07

细胞》子刊:科学家发现长期吸烟引起的肺细胞DNA表观遗传变化或是肺癌发生的第一步

 毋庸置疑,吸烟是导致肺癌的罪魁祸首。研究发现,肺癌死亡总数中的70%是由吸烟引起的!但是吸烟究竟是如何引起肺癌的,科学家一直都没有给出解释。近日,约翰霍普金斯大学研究人员给出了答案:香烟烟雾会导致细胞发生异常的DNA甲基化,进而使抑癌基因表达量下降,这会引起促进细胞生长的KRAS基因表达量升高,如果这个烟民的KRAS基因恰巧发生了致癌突变(1/3的吸烟肺癌患者携带这个突变),那么启动肺

2017-09-20

谈一谈单细胞代谢

代谢组学是20世纪90年代中期发展起来的一门新兴学科,研究对象大都是相对分子质量在1000以内的小分子物质。这门继基因组学、转录组学和蛋白质组学之后出现的学科经过二十多年的发展目前已经在疾病早期诊断、药物靶点发现、疾病机理研究及疾病诊断等方面取得了许多重大进展。生物学研究的历程往往要经过从宏观表型的观察到微观机制的探索,最后再回到宏观表型的解释和修正这样一个过程。在代谢组学出现之前,就有科学家已经

2017-09-04

李海涛研究近期在《自然化学生物》和《美国科学院院刊》发表合作论文利用和开发微阵列互作技术促进表观遗传研究

发表在《自然化学生物学》上的题为《应用蛋白微阵列技术研发Spindlin1小分子抑制剂》(Developing spindlin1 small-molecule inhibitors by using protein microarrays)的论文,通过构建组蛋白阅读器结构域蛋白芯片,并结合基于结构的构效关系演化,开发出专门针对Spindlin1的活性小分子抑制剂,为今后模式结构域靶向的药物筛选与

2017-09-09

利用单细胞甲基化鉴定出新的神经元亚型

图片来自Salk Institute/Jamie Simon。2017年8月13日/生物谷BIOON/---在显微镜下,人们很难区分任何两个神经元之间的区别。神经元是储存和处理信息的脑细胞。因此,科学家们利用分子方法,试图鉴定出具有不同功能的神经元群体。如今,在一项新的研究中,来自美国沙克生物研究所和加州大学圣地亚哥分校的研究人员首次分析了单个神经元中的DNA分子发生的化学修饰,从而提供迄今为止最

2017-08-13

AJHG:11家遗传机构呼吁谨慎使用人类生殖细胞基因编辑技术

2017年8月6日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,11个从事遗传学研究的组织关于对人类生殖细胞系进行基因组编辑发布了一份声明,声明中研究人员不推荐在人类怀孕达到顶峰时进行基因组编辑,但研究人员希望将体外研究推向潜在的临床应用中。相关研究刊登于国际杂志The American Journal of Human Genetics上。图片来源:medicalxpress.com来自斯坦福大学的遗传

2017-08-06

Nat Methods:新型基因工具CITE-seq或能实现单细胞大规模多维度分析

2017年8月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中,来自纽约基因组研究中心(NYGC)的研究人员通过研究开发了一种新技术,或能帮助推动单细胞RNA测序的进程,单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域,其能够帮助研究人员深入解读单细胞的特性,同时还能够帮助有效区分不同的细胞类型,以及在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。图片来源:N

2017-08-02