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Genome Biology:开发出单细胞基因单分子测序新方法

单细胞全基因组测序技术(scWGS)可以有效揭示生物样品中不同细胞之间的异质性,并系统鉴定单个细胞的基因组中发生的遗传变化,例如拷贝数变异(CNV)和点突变(单核苷酸变异,SNV)等。过去十年,研究人员已经开发出多种单细胞基因组扩增技术,例如简并寡核苷酸引物PCR扩增技术(DOP-PCR)、多重置换扩增技术(MDA)、多重退火和基于环的扩增循环技术(MALB

2021-07-07

Journal of Genetics and Genomics:单细胞分辨率绘制水稻幼苗叶和根的转录图谱

  水稻作为重要的粮食作物,为全球一半以上的人口提供主粮;同时,水稻作为单子叶模式植物,其个体发育与细胞分化受到了科研人员持续和广泛的关注。细胞功能的分化常常可以体现为基因表达的差异。新兴的单细胞转录组测序技术使高通量探究细胞的功能分化成为可能。绘制水稻全苗单细胞转录图谱将为单子叶植物的研究工作提供关键的基础资源,为理解植物发育的转录调控

2021-06-24

Protein & Cell:绘制出灵长类海马衰老的单细胞转录图谱

  海马体作为脑的重要组成部分,在学习和记忆中发挥重要作用。随着年龄增长,海马功能逐渐退化,导致认知功能的减退以及多种人类神经退行性疾病发生。由于海马结构复杂,细胞组成具有高度异质性,传统研究技术难以精确揭示海马衰老过程中不同细胞类型的衰老规律及分子调控网络。此外,由于伦理及样本来源的限制,不同年龄阶段的健康人类海马组织很难获取,这在一定

2021-06-02

研究开发CoTECH实现单细胞多维表观重构

细胞命运或状态由多维度染色质修饰景图及其调控基因表达谱决定。虽然各类组蛋白修饰、转录因子结合等表观因子调控的机制与结果各异,却协同决定了基因的选择性表达。全局性的研究多维度的表观因子相互作用有助于理解生命发育基因表达调控的机制和细胞命运的决定,以及疾病发生过程基因表达异常的原因,为疾病的治疗提供理论基础。虽然目前已有多种能在单细胞水平上高精度解析单一表观修饰

2021-05-08

研究揭示人类衰老细胞空间基因表观调控核心机制并绘制衰老相关染色质全局景观图谱

   中国科学院上海营养与健康研究所研究员孙宇课题组经合作研究在Nature Aging上,在线发表题为KDM4 Orchestrates Epigenomic Remodeling of Senescent Cells and Potentiates the Senescence-Associated Secretory Ph

2021-05-19

PNAS:“实时”转录揭示果蝇接种肿瘤细胞后的免疫防御机制

此前研究发现,通过将致癌的RasV12细胞注射到成年雄性果蝇中,会在经过几天的滞后期后大量繁殖,并导致2至3周后果蝇死亡。针对这一现象,来自法国斯特拉斯堡大学的Jules A. Hoffmann团队等人对细胞注射期间的转录组特征进行了研究。相关结果发表在最近的《PNAS》杂志上。

2021-04-07

Science:间歇性“休整”通过表观遗传重塑过程恢复CAR-T细胞功能

嵌合抗原受体T细胞疗法(简称 “CAR-T”)正越来越多地被应用于肿瘤患者的治疗。 CAR-T细胞疗法在血液系统癌症患者中显示出令人鼓舞的结果,但其抗癌活性可能受到CAR-T细胞功能有效性的限制。 在最近一项研究中,来自斯坦福大学医学院的Crystal L. Mackall教授课题组表征了连续活动引起的CAR-T细胞衰竭相关的表型和表观基因组变化,以及短暂休

2021-04-03

表观遗传疗法可以将杀伤性T细胞变成杀死癌细胞的高手

2021年2月25日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自加拿大大学医疗网络玛嘉烈公主癌症中心和多伦多大学的研究人员通过开展一系列优雅的实验,构建出特定白细胞的“超级士兵”来提高抗肿瘤反应。具体而言,他们描述了一种修饰DNA的表观遗传学疗法,可以通过增强杀伤性T细胞杀死癌细胞的能力,将它们转化为“超级士兵”。相关研究结果于2021年2月19日在线

2021-02-25

单细胞转录中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构

  美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心Nicholas E. Navin团队开发出新方法,可从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构。该研究于近日在线发表于国际一流学术期刊《自然—生物技术》。研究人员表示,单细胞转录组学分析被广泛用于研究人类肿瘤。然而,将肿瘤微环境中的正常细胞类型与恶性细胞区分开并解析肿瘤内的克隆亚结构仍然具

2021-01-22

Cancer Cell: 蛋白质为治疗头颈部鳞状细胞癌提供了新见解

近日,一项新研究通过蛋白质组学分析方法确定了头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的三种分子亚型,可能会提供新的见解,以匹配针对癌症患者的针对特定癌症的有效疗法。该研究由贝勒医学院,约翰·霍普金斯大学和美国国家癌症研究所的临床蛋白质组学肿瘤分析联合会(CPTAC)领导,相关结果发表在《Cancer Cell》杂志上。

2021-01-12