Nature：基于机器学习的工具BoostDM可识别每种肿瘤类型的癌症驱动突变，有助开发个性化癌症治疗
2021年8月4日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自西班牙巴塞罗那生物医学研究所的研究人员开发出一种计算工具，它可以识别每种肿瘤类型的癌症驱动突变。这一发现有助于加速癌症研究，并提供工具帮助肿瘤学家为每名患者选择最佳治疗方法。相关研究结果于2021年7月28日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“In silico saturation
BMJ：大量摄入超级加工食物或与机体炎性肠病发病风险增加直接相关
2021年7月17日 讯 /生物谷BIOON/ --炎性肠病（IBD）是一种机体胃肠道的慢性炎症疾病，其包括克罗恩病和溃疡性结肠炎，炎性肠病的病理生理学特征被认为与肠道粘膜的免疫系统激活有关，从而会对遗传易感性人群机体胃肠道的菌群失调产生反应。饮食会改变机体的微生物组并修饰肠道免疫反应，从而在炎性肠病的发病过程中扮演着关键作用。近日，一篇发表在国际杂志BMJ
JAMA Pediatrics：超加工食品对儿童的毒害，远超人们的想象！
越来越多的证据表明，超加工食品（UPF）对机体健康有着潜在的危害。根据NOVA食品分类系统的定义，超加工食品是经过一系列物理、化学和生物过程在已经加工过的食品基础上再加工的食品，这类食品通常含有五种以上工业制剂，并且是高糖、高脂、高热量的食品，其宗旨是廉价、口味好、方便和吸引人。
Nature子刊：通过机器学习模型识别复杂疾病的重要生物标记物
2021年5月27日讯/随着高通量技术的发展，通过世界各地研究人员的共同努力，形成了大型公共数据库，如癌症基因组图谱（TCGA）。这对阐明疾病表型的分子机制具有重大意义。然而，由于癌症等复杂疾病的病理以及其在遗传、基因组和蛋白质组水平上复杂的分子机制，研究复杂的人类疾病仍具有挑战性。目前，已有很多基于机器学习的方法开发出来，包括非线性核支持向量机（SVMs）
Nat Med：开发出新型机器学习技术 或有望改善胎儿先天性心脏病等出生缺陷的筛查
2021年5月30日 讯 /生物谷BIOON/ --先天性心脏病（CHD，Congenital heart disease）是一种最常见的出生缺陷，胎儿超声筛查能提供5个心脏视图，而这些视图能帮助检测90%的复杂先天性心脏病，但在医学实践中，这种筛查的敏感性会低至30%。日前，一篇发表在国际杂志Nature Medicine上题为“An ensemble o
Nature 子刊：多组学数据与机器学习识别新的癌症基因
癌症基因的鉴定在精准肿瘤学和癌症治疗学的发展中起着至关重要的作用。癌症的进展被认为是由驱动基因突变的积累引起的，这些突变赋予细胞选择性的生长优势。在过去的几年里，人们致力于从遗传大数据中找出癌症基因，预测癌症基因的最初方法是寻找显着突变的基因，然而，目前已知的癌症基因（KCG）目录的完整性仍存在争议。尽管成千上万的癌症基因组序列有助于癌症基因的鉴定，但仍存在
科学家又确定了加工食品伤肾的分子机制
如今，有相当一部分人每天都在大量摄入即食食品，如面包、饼干和各种零食等。这些食品都是经过高度热加工过的，在加工过程中改变了食品化学结构，从而延长了食品保质期、适口性和感官特性，而且还有可能因刺激了大脑的奖赏中心，而导致你一次吃好多。已有诸多研究表明，由富含脂肪、糖和盐的加工食品对人类健康有害，它与全因死亡率、糖尿病、非酒精
Science子刊：揭示加工食品为何会引发慢性肾脏疾病
2021年4月6日讯/生物谷BIOON/---加工食品是西方饮食的一个重要标志。现在有越来越多的证据表明，加工食品对人类健康有害。在过去的几十年里，经过热处理的加工食品的供应和消费大幅增加，这伴随着肥胖和糖尿病的流行。肥胖和糖尿病与微血管并发症有关，特别是慢性肾脏疾病（CKD）。CKD影响了近14%的普通人群，本身就是心血管疾病和全因死亡的主要风险因素。越来
Cell: 新型CRISPR转录组学编辑“机器”有助于重塑转录组记忆
基因编辑技术的进步大幅提升了我们修饰人类基因组的能力。基于sgRNA介导的CRISPR- Cas9相关基因编辑技术能够在指定位点引入DNA断裂以失活基因功能或通过同源性DNA修复引导精确的DNA编辑，这些技术已针对基础DNA序列的靶向变化进行了优化，因此非常适合修复或引入致病性突变。然而，上述技术对内源性DNA修复机制的依赖提出了挑战，因为这些途径的复杂性可能使其难以进一步提升精确性。
AJCN：大量摄入加工肉类或会增加个体患心血管疾病及死亡的风险
2021年4月2日 讯 /生物谷BIOON/ --日常膳食指南中建议人们要限制饮食中红肉的摄入量，因为其是中链和长链不饱和脂肪酸（SFAs）的主要来源，据推测其会增加人们患心血管疾病的风险，然而目前研究人员分析未加工红肉的摄入和心血管疾病风险之间关联的证据并不一致。近日，一篇发表在国际杂志The American Journal of Clinical Nu