循环血微小RNA在诊断急性心肌梗死中的应用前景
随着我国经济的发展和人民生活水平的提高、饮食结构和环境因素的改变,以血管功能失衡为病理学基础的心脑血管疾病的发病率呈逐年上升趋势,对我国人民群众健康构成了极大威胁。
最近研究表明,多种miRNA参与了胚胎发育、心血管疾病发生、肿瘤发生等生理病理进程。MiRNA在不同组织中具有不同的表达谱,在循环血中并具有较高的稳定性。各种组织在不同原因引起的损伤时,循环血中miRNA含量会发生相应的改变,有可能在相关疾病的发生发展中作为分子标志物。
我们在研究中发现,心肌特异的miR-208a能够作为心肌缺血的血清标志物,具有较高的灵敏性和特异性。血管损伤及随后由其引起的重塑在冠心病、高血压等心脑血管疾病中也发挥重要作用,研究表明循环血miRNA也具备作为血管损伤重塑相关疾病的血清标志物的潜在价值。
miRNA生物信息学及其在医学研究中的应用
miRNA是一类重要的基因调控因子,越来越多的证据表明miRNA在许多重要的生命过程中发挥着关键作用。因此,和miRNA有关的功能异常和许多疾病有关(根据人类miRNA疾病数据库, HMDD, http://cmbi.bjmu.edu.cn/hmdd, 的统计,目前已经有近400种人类疾病被报道了和miRNA有关)。因此,miRNA正在成为理解疾病发生发展机制的明星分子,并且疾病的预防、诊断与治疗中具有巨大的潜在的应用价值。从有关miRNA研究的一开始,生物信息学在其中就发挥着重要作用。从miRNA发现到靶基因预测,从分子进化到网络调控,从疾病易感位点确定到疾病miRNA关联分析,都可以看到生物信息学的身影。在本报告中,报告人将重点介绍本人实验室在miRNA-疾病-药物之间关系的生物信息学研究,从大规模数据分析到建模和预测,同时概括miRNA生物信息学在医学研究中的应用。
晶芯® 人类长链非编码RNA芯片V3.0的设计及在疾病研究中的应用
长链非编码RNA (lncRNA)以RNA的形式在多种层面上,通过影响染色质状态,RNA转录和翻译层面调控基因的表达。近年研究者非常关注lncRNA在各种生物学过程和疾病过程中所起到的作用,形成了新的研究热点。 博奥生物与中科院生物物理所陈润生院士研究组,基于已经公布的大量lncRNA数据库及实验室发现的800多条中等长度的非编码RNA,推出了自主设计的lncRNA芯片。继成功推出lncRNA V1.0 和 V2.0 芯片基础上,鉴于当前lncRNA 研究的快速进展,收集和更新lncRNA 序列信息,经过严格的序列筛选和整合,推出了新一代的晶芯lncRNA V3.0 芯片服务。最新的V3.0芯片包括约3.8万条lncRNA和约3.4万条mRNA探针,可以同时针对lncRNA和mRNA进行检测。在充分保证探针容量和重复数量(lncRNA和mRNA检测探针均重复2次以上)的前提下,降低了芯片成本和实验费用。在检测成本和检测准确性之间达到较好的平衡点。 通过lncRNA芯片检测,研究人员能够迅速获得与特定生物学过程或者疾病相关的lncRNA的表达变化,从而发现与特定生物学过程相关的lncRNA,寻找与疾病相关的lncRNA。
癌症干细胞表达的细胞朊蛋白在大肠癌中的应用
中科院动物所陈佺教授介绍了CSCs表面的一种新型标记分子PrPc,PrPc在调节CSCs的EMT过程中十分重要,可以作为一种治疗结肠癌转移的新型靶标。
蛋白质组学技术在植物逆境生物学研究中的应用
课程主要从蛋白质组学技术在植物逆境生物学中的应用,蛋白质组学相对定量技术--iTRAQ,基于蛋白质组学数据的生物信息学分析方法几个方面展开。
乙肝快速检测试剂在POCT中的应用及标准探讨
乙肝血清学标志物快速检测试剂已广泛应用于手术前检测,现场献血员筛查等其他应急检测,以及基层医疗机构常规临床检测,检测内容包括HBsAg、Anti-HBs、HBeAg、Anti-HBe、Anti-HBc 等常规的5项乙肝标志物,这些快速检测试剂具有较传统方法更为快速、简便的特点,在POCT检测中具有一定的临床应用意义。
乙肝快速检测试剂多采用胶体金法,其他方法包括胶体硒法、乳胶法等,其原理与传统方法的酶联免疫法相同,由于判断方法的不同,操作过程快速、简便,与酶联免疫法、化学发光法等试剂质量标准存在差异,主要表现在灵敏度方面,HBsAg最低检出量,酶联免疫法试剂可达到0.05~0.1IU/ml, 快速检测试剂仅为4~5 IU/ml,Anti-HBs最低检出量,酶联免疫法试剂10IU/ml, 快速检测试剂30 IU/ml,另3种乙肝标志物最低检出限酶联免疫法试剂均高于快速检测试剂2~3倍稀释度。因此,快速检测试剂也在临床应用受到一定的限制。
乙肝快速检测试剂属于医疗器械管理,在众多的乙肝试剂申报注册中尚无快速检测试剂进口注册,已申报的注册产品标准存在不规范,目前已建立了乙肝5项试剂的国家参考品,为制订该产品的医疗器械行业标准提供依据。
SynVivo的应用
SynVivo是一款模拟体内血管环境的微流体芯片,可以模拟仓鼠、大鼠和小鼠的不同血管。提供形态和生物学仿真微环境,可以对药物等微粒与细胞的相互作用进行实时观察研究,其中一些特殊芯片可以培养特定组织类型的细胞,如神经元、肝细胞或肿瘤细胞等。
SynVivo在体外条件下,利用微循环网络模拟在体条件下细胞/微粒粘附、细胞-细胞或细胞-微粒相互作用。研究流体和形态对药物研发和细胞研究的影响.。得到剪切力-粘附效应图,分叉与分支粘附效应等。研究人员只需用适当的底物覆盖微芯片的通道(如纤连蛋白),然后在其中培养细胞,就可以建立人工的体内环境。这一系统可通过流动的液体来模拟天然的血液。
SynVivo在细胞行为、药物粒子粘附和吸收机制、药物输送、药物发现、药物毒性分析等领域有广泛应用。
肠道腺病毒载体在细胞治疗中的应用潜力
细胞治疗作为一种新型的人类疾病治疗手段,近年来细胞治疗这一新型治疗手段取得了可喜的成果,但我们还有很多方面需要进行深入地探讨,比如哪些是适合移植的最佳细胞类型,细胞移植的数量和间隔,移植的部位,移植后细胞在体内的具体机制等确切的作用机制等,以及临床应用的有效性和安全性依然是目前科学家关注和争论的焦点。
核酸质谱分析技术在基因组学,肿瘤研究及转化医学中的应用
通过监督循环肿瘤细胞的数量和踪迹,医生就能提早发现病人会不会再度患上癌症,也能了解化疗或其他治疗是否对病人产生效果。
邓杏飞:高通量新一代基因测序技术(NGS)在临床医学研究和诊断中的应用
新一代基因测序(NGS)技术正迅猛发展,检测技术日趋成熟,检测费用也不断降低。NGS在医学研究和临床诊断应用方面正在不断扩大。这些都提示NGS正被广泛应用的黄金时光比人们原先预测的来得快。 除了简要分享NGS的技术发展现状,市场应用前景和NGS在临床医学和基因疾病诊断中的重要应用外, 我将特别探讨无创伤产前基因筛查(包括母血游离DNA和完整胎儿细胞单细胞基因检测)和NGS的应用, Ion Torrent基因定型和肿瘤方面的一些最新研究进展和实验资料。