生物信息学:如何使用纳米孔数据对基因组甲基化进行检测和定相
表观遗传学是有关化学修饰的研究,这是一个正在蓬勃发展的研究领域,研究人类表观遗传修饰(包括对 DNA、RNA 和组蛋白的修饰)对于很多领域具有重要意义。然而,传统检测表观遗传学的技术存在一些局限性。例如,短读长测序技术包含聚合酶链式反应 (PCR),在这期间会丢失表观遗传修饰。由于其不能对甲基化直接测序,因此在测序前需要对 DNA 样本进行化学处理,以此推断甲基化的存在。 纳米孔测序可在无需 PCR 的情况下,制备和测序天然 DNA 和 RNA 分子。这样就可以在检测核苷酸序列的同时直接检测完整甲基化,无需任何化学转化或额外的文库制备步骤。端到端的纳米孔工作流程具备简单的文库制备流程,结合灵活的测序选项,可满足各类实验目标,针对靶向区域或人类全基因组提供了前所未有的甲基化解决方案。 11.23日,来自Oxford Nanopore 应用团队的生物信息学家Philip将为大家介绍如何使用纳米孔数据对基因组甲基化进行检测和定相,主要内容有: 甲基化定义及其重要性 如何进行甲基化分析,需要什么样的数据,读长建议 利用纳米孔测序技术进行甲基化检测的结果与分析
呼吸消化道疾病类器官模型与再生医学前沿法律问题讨论 空中讲坛
从2020年年初,全球科研工作者的大量研究结果表明,新冠病毒会感染如胃肠、肺、心脏、肾脏、肝脏等人类器官。如研究表明新冠病毒感染者出现腹泻、恶心和腹痛等表现,可能是由于新冠病毒感染者胃肠道出现消化道细胞生理功能障碍所致。也有研究表明,肺作为呼吸道病毒最容易攻击的地方,有新冠病毒感染者可能伴随的炎症反应,继而爆发急性呼吸窘迫综合征(ARDS)。 类器官属于三维(3D)细胞培养物,能够包含其来源组织的一些关键生理特性,从而提供一个高度生理相关系统,其构建的疾病模型正被逐渐广泛应用于诸如新冠病毒等呼吸道感染疾病、肿瘤疾病的研究,为发现疾病发生机制提供了更高效的研究途径,同时,也加速了相关疾病的药物筛选。 为探讨类器官技术在呼吸消化疾病研究方面的应用,以及再生医学前沿法律问题,生物谷特与天九再生医学共同主办“呼吸消化道疾病类器官模型与再生医学前沿法律问题讨论”空中讲坛,邀请相关领域的资深专家,共同探讨类器官技术在呼吸消化疾病方面的前沿成果以及再生医学前沿法律问题。
“生物制药:创新药物研发与免疫治疗的转化” 空中讲坛
近年来,我国创新环境、法规政策、新药研发环境、新药研发能力、监管体系都发生了深远积极的变化,《“健康中国2030”规划纲要》也明确指出:要深化医疗体制改革,加快健康人力资源建设,推动我国健康科技创新发展。国内外各大制药企业纷纷通过合作共赢来实现原研助力健康中国,创新守护患者生命。 在中国医疗健康需求持续走高的新要求下,各大制药企业纷纷加大原研技术的发展速度和布局,助力应对人类衰老、癌症、免疫学、心血管疾病、干细胞、肾病学、糖尿病、肥胖等代谢性疾病及其发生机制、药物筛选、转化科学等内容的研究和探索。 先进的研发技术是创新药研发的必经之路,包括创新药物的研发设计、细胞功能代谢分析技术、转化科学、临床试验等众多内容。本期由生物谷携手安捷伦带来精彩的主题报告分享,欢迎收听本次讲坛。
“智能自动化驱动变革,提速生物样本库建设” 空中讲坛
随着中国生物样本库的蓬勃发展,生物样本库的建设规模和类型也趋于多样化,规范化的质量控制标准不断完善,信息化管理不断升级。生物样本库的应用范围也趋于广泛,研究者可应用优质的样本资源,在各个领域开展研究工作,对提高科研效率,探索人类疾病新的治疗途径,开拓新的诊治手段,优化医药研发的资源配置都具有不可替代的重要作用,极大地推动了健康事业的快速发展。 生物谷携手华大智造,邀请相关行业专家为大家解读生物样本库的智能化应用与发展。
“聚焦产学研 共话iPSC在细胞治疗中的应用与产业化发展” 空中讲坛
iPSC正在各种细胞疗法应用中进行探索,目的是逆转机体损伤或疾病进而达到治疗疾病的效果。取自患者自体的体细胞经诱导后成为iPSC,可分化成特定类型的体细胞从而逆转机体损失或疾病,同时避免了免疫排异、伦理学等问题。通过从感兴趣的疾病患者中生成 iPSC,并将其分化为疾病特异性细胞,通过这种方法,iPSC 可以“在培养皿中”有效地建立疾病模型。此外,iPSC具有提供生物学同类的细胞类型的潜力,这些细胞可以用于针对各类组织细胞的化合物鉴定、筛选,靶标验证,和作为新药发现的工具。
消化道类器官技术发展与前沿应用
类器官(Organoids)早在上世纪就已诞生,但发展缓慢。直至近十年,类器官技术才突飞猛进,引来高速发展阶段。类器官的发展是干细胞领域的重大突破之一,是源自于自组织干细胞的体外3D培养体系,具备起源组织的体内结构、功能及基因等重要特征。目前,类器官培养已用于各种组织,其中包括肠道、肝脏、胰腺、肾脏、前列腺、肺、以及大脑及神经。其培养应用也被逐渐用于多项研究应用中,包括细胞生物学、再生机制、精准医疗以及药物毒性和药效试验等等,具有巨大的应用潜力。 10月27日,生物谷携手Bio-Techne聚焦消化道类器官目前的发展及技术应用场景,邀请业内专家在本期空中讲坛“消化道类器官技术发展与前沿应用”中,分享当下消化道类器官技术的应用进展和相关的临床前试验应用及相关的难点与突破点,相信将给广大同行带来灵感启迪,欢迎广大同行共同参与。
多重免疫组化学在人类疾病研究中的应用
在人类疾病研究中,我们往往需要借助不断更新迭代的先进技术来实现人类疾病的认知以及相关治疗。 我国有上亿脑神经疾病患者,由于脑神经收到损伤或者发育异常所致,包括自闭症、抑郁症、阿尔兹海默症、帕金森综合征、脑中风、中枢神经系统脱髓鞘疾病、自身免疫性脑炎等。此外,据国家癌症中心数据显示,我国恶性肿瘤发病、死亡数持续上升,每年恶性肿瘤所致的医疗花费超过2200亿。 多重免疫组化技术可以在一张组织切片上进行多重生物标志物检测的技术,主要利用不同标记物标记的抗体识别组织切片上的靶蛋白,再通过不用的实验平台或者专业仪器实现图像的采集与分析。由于获得的生物学信息众多,不仅可以对组织细胞原位靶标类别、组分、表达量等信息进行分析,还可以研究各靶标相互作用的空间位置信息, mIHC 技术在脑神经科学、肿瘤微环境,肿瘤异质性及肿瘤发生发展等研究中均能发挥重要。 12月13日,生物谷联合Bio-Techne召开空中讲坛——《多重免疫组化学在人类疾病研究中的应用》,邀请致力于神经科学、肿瘤等人类疾病发生机制及相关技术等研究领域的专家,分享当前的研究进展,相信将为基础研究和临床工作起到启发作用。