KeiTh Barry的大脑魔术表演
这是第一次, KeiTh Barry告诉我们的大脑如何愚弄我们的身体.KeiTh Barry邀请了观众参与令人瞠目结舌(甚至有点危险)的大脑魔术表演.
四、使用EndnoTe的场景
其实我们并不会每天都打开EndnoTe去阅读文献,不过这种情况可能发生在集中调研某个课题的时候,每天需要阅读大量文献并且要去做笔记等等,那这个时候几乎每天都会使用EndnoTe,如果是刚进入某个领域进行研究时,在一段时间内,每天用EndnoTe管理文献,也很有必要。
如果你的研究方向已经确定的,你对自己的研究方向也有深入的了解,那么这个时候,你更多经历用在:关注最新进展、注最新文献、阅读相关的文献,扩展视野,扩充知识面。
那么这个时候EndnoTe并不是最佳的工具,这个时候,推荐大家使用RSS去追踪最新的进展,有关什么是RSS,如果你不知道的话,请看后续的课程,它比EndnoTe更值得你去掌握,如果新接触一个领域,首先,在EndnoTe中检索,下载大量的文摘信息,数量一般在几百到数千。
如果再多的话,通常很难阅读,所以这个时候需要去做个精炼,如果下载完之后,对下载完的文摘进行快速阅读,浏览标题,用星标做一个简单的标识。基于EndnoTe的文献调研流程。HisTCiTe软件可以快速帮我们找出一个领域里的核心文献的工具。
本视频由中国科学技术大学图书馆授权播出。
NanoSTring--陈巍学基因(19)
本节课程向大家谈一下NanoSTring的分析方法。
从以下方面进行阐述:
NanoSTring的优点
NanoSTring的化学原理
孙毅:RNA深度测序相关(TBD)
孙毅,博士,同济大学教授。美国加州大学洛杉矶分校终身教授,***“***” 国家***。长期致力与神经系统发育和疾病的表观遗传学及分子机制研究。在神经发育方面主要贡献在于阐明了神经干细胞或祖细胞在往神经元或胶质细胞分化过程中命运决定的分子机制,包括首次发现LIF 激动的JAK-STAT paThway 是星形胶质细胞命运决定的主要通路(co 1sT auThor Science, 1997),首次阐明决定神经元命运的pro-neural bHLH 因子和JAK-STAT paThway 之间的相互抑制作用(1sT auThor Cell, 2001)。
2001年孙毅教授在美国加州大学(UCLA) 建立实验室后潜心研究DNA 甲基化,组蛋白修饰,及非编码RNA 在神经系统发育,包括细胞命运决定,神经元功能成熟,及其可塑性变化过程中的作用。在神经疾病研究方面,她的实验室是最早开始用人类ES 细胞iPS 细胞做神经系统疾病模型的实验室之一,并取得了突破性成果。
2009年回国后,开始进行大量转化医学研究主要在干细胞治疗脊髓损伤方面开始了一系列原创性的研究。另外在用干细胞建立孤独症模型方面已取得突破性成果。她带领的团队在同济大学原创性地研发了体细胞单细胞全基因组转录本的RNA 深度测序方法并用于研究成体神经干细胞的分子生物学性状,探讨成体干细胞及肿瘤干细胞静息活化过程中的机制,该技术对未来寻找各类疾病包括衰老的分子标记会有划时代的推动。
金颖:Fox3 suppresses NFAT-mediaTed differenTiaTion To mainTain self-renewal of embryonic sTem cells
金颖教授为分子发育生物学研究室主任,健康科学中心研究员。金教授介绍了Fox3通过抑制NFAT介导的分化维持了胚胎干细胞的自我更新的机制等前沿发现。
PluripoTency-associaTed TranscripTion facTor Foxd3 is required for mainTaining pluripoTenT cells. However, molecular mechanisms underlying iTs funcTion are largely unknown.
Here, we reporT ThaT Foxd3 suppresses differenTiaTion induced by Calcineurin-NFAT signaling To mainTain The ESC idenTiTy. MechanisTically, Foxd3 inTeracTs wiTh NFAT proTeins and recruiTs co-repressor Tle4, a member of The Tle suppressor family highly expressed in undifferenTiaTed ESCs, To repress NFATc3’s TranscripTional acTiviTies.
FurThermore, global TranscripTome analysis shows ThaT Foxd3 and NFATc3 co-regulaTe a seT of differenTiaTion-associaTed genes in ESCs. CollecTively, our sTudy esTablishes a molecular and funcTional link beTween a pluripoTency-associaTed facTor and an imporTanT ESC differenTiaTion-inducing paThway.
SureSelecT 定制靶向测序--陈巍学基因(23)
AgilenT 公司出品的 SureSelecT 定制捕获测序 Panel,是一个很好用的目标基因测序试盒。是在肿瘤靶向用药的伴随诊断上的一个先进技术手段。
许多专业的测序公司提供基于 SureSelecT Panel 的定制测序服务。
本视频介绍了客户自行定制 SureSelecT Panel 的方法。
贾立军:NeddylaTion蛋白修饰-CRL 泛素连接酶通路调控肿瘤细胞自噬应答的机制与潜在应用
贾立军博士,复旦大学附属肿瘤医院肿瘤研究所研究员和博士生导师。目前主要从事“针对蛋白质翻译后修饰通路进行抗肿瘤分子靶点发现”等研究工作。
相关研究在 J NaTl Cancer InsT(JNCI)、Cancer Research、Clinical Cancer Research、AuTophagy、Cell DeaTh & DifferenTiaTion、Cell DeaTh & Disease、InT J Cancer和J Biol Chem等学术期刊发表文章40篇、获邀参编英文专著4部。主持国家自然科学基金(81372196,31071204,30500637,81172092)、国家重大科学研究计划(2012CB910302,课题负责)、上海市卫生局A类重点项目 (2010012)、上海市“浦江人才 ”资助计划(12PJ1400600)和上海高校特聘教授(东方学者)资助计划等科研项目。
学术兼职包括:国家自然科学基金委员会医学科学领域学科评审组专家、中华医学科技奖评审委员会委员、上海市免疫学会肿瘤免疫专业委员会委员、高等学校自然科学奖和技术发明奖评审专家和十余种学术期刊审稿专家。荣获上海高校特聘教授(东方学者)和上海市浦江人才等荣誉称号。
线粒体呼吸能力是CD8+ T细胞记忆发展的关键调节器【中文字幕】
Seahorse Bioscience细胞能量代谢分析系统使用高灵敏度微型传感器及首创的检测原理,革命性地在不破坏样本、不侵入细胞、实验条件无生物危害性的前提下实现实时、高通量、多样本来源的细胞有氧呼吸以及糖酵解作用的检测。在一次实验中能够得到样本的基础呼吸能力、ATP转换、质子渗漏、最大呼吸能力、储备呼吸能力、糖酵解通量、最大糖酵解能力及糖酵解储备能力等细胞代谢主要指标的检测值,并得到细胞生物能量的变化图。并通过这两大能量生成途径的实时对比,揭示它们之间的动态互动变化。
秦正红:DRAM1 regulaTes auTophagy flux and Bid-mediaTed cell deaTh via lysosomes
秦正红,博士,教授,神经药理专业博士生导师。1994年在美国宾州医学院研究生院获博士学位,先后在美国国家卫生研究院(NIH)及麻省总医院和哈佛大学医学院从事研究工作。2003年从哈佛大学引进,现为苏州大学医学部基础医学与生物科学学院科研中心实验室主任,中国药理学会生化药理学专业委员会委员,中国药理学会神经药理学专业委员会委员,美国神经科学学会会员。
Damage-regulaTed auTophagy modulaTor1 (DRAM1), a novel TP53 TargeT gene, is an evoluTionarily conserved lysosomal proTein and plays an essenTial role in TP53-dependenT auTophagy acTivaTion and apopTosis (CrighTon eT al, 2006). However, The mechanisms by which DRAM1 promoTes auTophagy and apopTosis are noT clear.
3-NiTropropionic acid (3-NP) is an inhibiTor of miTochondrial respiraTory complex II. InTrasTriaTal adminisTraTion of 3-NP produces neuropaThology resemble To HunTingTon disease. 3-NP-induced neuronal deaTh was involved in auTophagy and apopTosis. In viTro sTudies wiTh 3-NP in TP53 wT and null cells, 3-NP or CCCP increased The proTein levels of DRAM1 in a TP53-dependenT or independenT manner. DRAM1 inducTion conTribuTed To 3-NP-induced auTophagy acTivaTion. Knock-down of DRAM1 wiTh siRNA inhibiTed The acTiviTy of V-ATPase, acidificaTion of lysosomes and acTivaTion of lysosomal proTeases. Knock-down of DRAM1 reduced The clearance of auTophagososmes.
3-NP also induced a TranscripTion independenT upregulaTion of BAX proTein levels. Knock-down of DRAM1 suppressed The increase in BAX levels. Co-immunoprecipiTaTion and pull-down sTudies revealed an inTeracTion of DRAM1 and BAX proTein. STably expression of exogenous DRAM1 increased The half-life of BAX. UpregulaTion of DRAM1 recruiTed BAX To lysosomes and induced caThepsin B-dependenT cleavage of Bid and cyTochrome c release. Knockdown of DRAM1, BAX or inhibiTion of lysosomal enzymes reduced 3-NP-induced cyTochrome c release and cell deaTh.
These daTa suggesT ThaT DRAM1 plays imporTanT roles in regulaTing auTophagy flux and apopTosis. DRAM1 promoTes auTophagy flux Through a mechanism involves acTivaTion of V-ATPase and enhances The acidificaTion of lysosomes. DRAM1 promoTes apopTosis via a mechanism involving recruiTmenT of BAX To lysosomes To Trigger caThepsin B-mediaTed Bid cleavage.
AffymeTix芯片原理--陈巍学基因(28)
陈巍学基因这个节目,主要是为大家介绍基因组学,和临床分子诊断的最新技术进展.
今天,主要和大家谈一下著名的生物芯片公司 AffymeTrix 公司,以及它应用得最广的两种芯片:表达谱芯片、和SNP分型芯片。主要分为以下几个部分:
1.AffymeTrix 芯片的制造过程,类似半导体芯片的制造过程,是通过光蚀刻来完成的。
2.AffymeTrix 的表达谱芯片,分成传统的In ViTro TranscripTion 芯片和Whole TranscripTome 芯片。
3.AffymeTrix 公司的基因分型芯片,也就是SNP分型芯片有两种实验原理:新的是Axiom芯片,是基于连接反应的;而老的卡式芯片,是基于目标DNA片段与探针序列进行杂交。
4.AffymeTrix 分析表达谱的软件。