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再生生物学多组学数据库发布

   随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据为基础,推动再生相关的基础研究和临床转化应

2021-10-11

北京大学生命学院李磊课题组发布植物microRNA数据库新版本

北京大学生命科学学院李磊研究员课题组与合作者在Nucleic Acids Research在线发表了题为“PmiREN2.0: from data annotation to functional exploration of plant microRNAs”的研究论文。该论文介绍了植物microRNA综合数据库PmiREN的最新版本。MicroRNA是真核

2021-10-06

Trends in Biotechnology:科研人员首次提出“空间位置效应”概念

近期,Trends in Biotechnology在线发表了华中农业大学农业微生物学国家重点实验室、湖北洪山实验室何进教授研究团队的观点型论文“The spatial position effect: synthetic biology enters the era of 3D genomics”(空间位置效应:合成生物学迈向了三维基因组时代),该研究首次

2021-10-05

我国科学家建成并上线发表全球药典草药基因组数据库

   近期,中国中医科学院中药研究所团队建立了全球药典基因组数据库(GPGD)。该数据库是全球首个针对药典收载草药物种的大型基因组学数据库。相关研究成果发表在《Science China-Life Sciences》杂志,标题为“Global Pharmacopoeia Genome Database is an integra

2021-09-30

科学家发现利用人工智能可高效预测蛋白质分子结构

  近期,美国谷歌公司的科学家开发并利用AlphaFold系统,通过人工智能方式高效预测了35万种蛋白质的分子结构。相关研究成果在《Nature》发表,题为:Highly accurate protein structure prediction for the human proteome。解析蛋白质的分子结构对于基础研究、药物研发和疾

2021-09-27

天然无规蛋白的溶剂化模型研究中取得重要进展

近日,上海交通大学生命科学技术学院本科生在《J. Chem. Inf. Model.》期刊在线发表名为Balanced Solvent Model for Intrinsically Disordered and Ordered Proteins的研究成果,该研究为天然无规蛋白的功能研究提供了一种新的溶剂化模型。上海交通大学生命科学技术学院陈海峰教授课题组的

2021-09-24

研究人员发表无痕蛋白质酶法合成方法

从化学本质分析,蛋白质是胺基单元通过碳氮成键反应形成的生物大分子。因此,蛋白质的人工合成关键在于碳氮成键反应的精准控制。近年来,以多肽固相合成与特异性拼接为核心的蛋白质合成和修饰技术蓬勃发展,打破了核糖体合成系统仅能使用天然及少数非天然氨基酸的瓶颈。蛋白质人工合成技术能实现各种类型的化学修饰,拓宽了人类在原子水平上人工构筑蛋白质的可能性。而目前主流的多肽拼接

2021-09-17

Molecular Plant :发布RiceENCODE水稻表观基因组学数据库

Molecular Plant 在线发表了华中农业大学李国亮教授和李兴旺教授团队联合发表的题为 RiceENCODE: a comprehensive epigenomic database as rice Encyclopedia of DNA Elements 的研究论文,报道了一个整合水稻多元表观基因组数据的数据库。该数据库基于团队此前发表的水稻20个

2021-09-07

Parkinson’s Disease:探索帕金森病中人类基因组肠道-微生物组的相互作用

复杂疾病的病因仍然是个谜,尽管几十年来对环境风险的流行病学研究和全基因组研究发现了每种疾病的数十个或数百个易感位点。

2021-09-06

Nat Biotechnol:新型计算方法CoNGA为预测T细胞行为奠定基础

研究人员开发出一种称为CoNGA的新型计算方法,它可能有助于人们关注将T细胞受体(TCR)基因序列和T细胞功能相关联在一起的隐藏生物模式。此外,利用CoNGA,他们可以分析从单个T细胞中收集到的复杂数据,以揭示新的T细胞群体,并揭示塑造T细胞发育的TCR特征。

2021-09-05