各平台数据难以兼容?Journal of Advanced Research:这款工具打通空间转录组整合痛点,解读组织发育与病变
研究开发soDGVAE计算框架,攻克多源空间转录组数据整合难题,在发育生物学与疾病队列中完成验证,为空间组学分析提供实用新工具。
JHEP Reports 最新研究发现灵长类肝脏再生独有的分子开关,为肝病治疗开辟新方向
该研究利用食蟹猴肝部分切除模型构建肝脏再生时空多组学图谱,在肝小叶2区发现携带胎儿肝转录特征的高增殖肝细胞亚群,证实POU2F1是灵长类特有的肝脏再生调控因子,为肝脏疾病修复挖掘出新靶点。
阿尔茨海默病新靶点候选!Briefings in Bioinformatics:AI找到阿尔茨海默病早期神经元损伤核心基因DLG2
该研究搭建可解释人工智能分析框架,基于单核RNA测序数据识别阿尔茨海默病相关基因互作,证实DLG2是多类皮质神经元的核心枢纽基因,为解析疾病机制提供新方向。
Journal of Advanced Research:不用测序!一张病理切片就能读懂肝癌“隐藏性格”,AI依托常规病理图像预测肿瘤表型
该研究搭建病理分析体系,利用肝癌苏木精 伊红染色切片预测血管生成、干细胞特性、自噬转录表型,预测结果与患者预后、药物反应及免疫组化标志物存在显著一致性。
不再盲目碰运气!JCIM新计算平台,为EGFR、HER2、KRAS批量挖掘分子胶候选
本研究开发GlueFinder数据驱动计算平台,挖掘蛋白界面邻近可成药口袋,可预测分子胶候选物,拓展E3泛素连接酶选择范围,为分子胶理性发现提供实验优先级策略。
AI预测药物靶点,为什么总“看不全”?JCIM:用双曲几何捕捉层层嵌套结构,药物靶点预测更准、泛化更稳
研究搭建MML DTI多流形学习框架,引入双曲图神经网络融合多类分子信息预测药物靶点相互作用,多个数据集验证效果出色,为AI辅助药物研发提供新的思路。
告别逐个湿实验筛选!Journal of Chemical Information and Modeling:大模型助力耐药靶点挖掘,同步解析三类非编码RNA与药物应答关联
该研究搭建NCRDLLM统一框架,整合多维度生物信息,同时预测三类非编码RNA和药物应答关联,整体表现优于现有工具,助力肿瘤耐药相关靶点筛选。
千年草药宝库怎么挖?Chemical Science推出TCMBank,打通中药到新药的研究通路
研究开发免费中医药数据库TCMBank,梳理中药、化学成分、靶点蛋白与疾病的对应关系,结合筛选流程挖掘活性分子,为中药现代化和新药研发提供实用研究工具。
分子片段才是关键!Briefings in Bioinformatics:子结构预训练解锁AI分子性质预测新潜力
研究基于化学规则拆分分子片段搭建自监督学习框架,在11套药物分子测试集中7项取得最优结果,可抓取功能片段信息,缓解图神经网络过平滑缺陷,助力新药前期评估。
AI设计的分子,实验室合成不出来?上海药物所 JCIM:SynFrag帮你提前筛掉“算得出却做不出”的候选分子
该研究开发基于片段组装自回归生成的分子可合成性预测模型SynFrag,在多套数据集上表现稳定,可识别合成难度悬崖,兼顾预测效率与可解释性,服务人工智能辅助药物研发工作。