Cell：开发出将多种单细胞数据集结合在一起的新工具，有助确定细胞类型
2019年6月17日讯/生物谷BIOON/---单细胞研究揭示了可能在其他分析中被忽略的细胞细节。生物学家当前使用一系列方法来收集不同组织和物种的单细胞数据。一些科学家可能使用基于组织的原位方法来研究小鼠神经元中的DNA甲基化，而另一些科学家可能使用液滴方法来探究人神经元中的RNA表达。这些研究创建了许多独特的不易结合在一起的数据集。但是，将这些数据结合在一起来比较多个个体、组织和物种的相似细胞的
Nat Med：鉴定出与孕妇早产相关的阴道细菌
2019年5月31日讯/生物谷BIOON/---2008年，美国国家卫生研究院（NIH）资助了人类微生物组计划（Human Microbiome Project, HMP）---一个雄心勃勃的项目，类似于人类基因组计划，旨在描述生活在我们每个人身上的极其复杂的微生物。六年后，该计划扩展为综合性人类微生物组计划（integrative Human Microbiome Project, iHMP），
Gen Res：新型计算机工具有助于基因鉴定
2019年5月9日 讯 /生物谷BIOON/ --就像在大海捞针一样，识别与特定疾病有关的基因可能是一个艰巨而耗时的过程。为了改善这一过程，由贝勒医学院的研究人员领导的团队开发了一种新的生物信息学工具，可以分析CRISPR合并的筛选数据，并以比其他现有方法更高的灵敏度和准确度确定潜在相关基因的候选基因。新的基于网络的分析工具也更快，更友好，因为它不需要生物信息学培训来使用它。该研究发表在《Geno
Cell：新研究鉴定出杀死横纹肌肉瘤细胞的药物
2019年5月10日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国麻省总医院的研究人员开发出一种新的动物模型，该模型有望更便宜、更容易使用，并能改善针对癌症和其他潜在疾病的个性化治疗。具体而言，他们描述了利用他们的免疫缺陷斑马鱼模型在单细胞分辨率下可视化观察活体动物的药物反应。他们还为横纹肌肉瘤（rhabdomyosarcoma）---一种在主要儿童中出现的肌肉癌---确定了一种有前景的新
鉴定出一种独特的肠道干细胞可再生受损肠道
2019年5月10日讯/生物谷BIOON/---肠上皮的更替由位于隐窝区底部的多能性LGR5+隐窝基底柱状细胞（crypt-base columnar cell, CBC）驱动。然而，CBC在因辐射等导致的损伤后会丢失，但是肠上皮仍然能够恢复。因此，第二组静止的"+4"细胞，即储备干细胞（reserve stem cell, RSC），已被提出再生受损的肠道。尽管CBC和RSC被认为是相互排斥的，
研究发现大规模代谢物结构鉴定新算法MetDNA
近日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）杂志发表了由中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组的最新研究成果“Metabolic Reaction Network-based Recursive Metabolite Annotation for Untargeted Metabolomics”。基于液相色谱-质谱联用（LC-MS）技
Nat Methods：开发出一种新的基因组学工具ECCITE-seq，可扩展多模式单细胞分析
2019年5月10日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国纽约基因组中心的研究人员开发出一种称为ECCITE-seq的新技术，它允许科学家们对来自单细胞的多种信息模式进行高通量测量。相关研究结果发表在2019年5月的Nature Methods期刊上，论文标题为“Multiplexed detection of proteins, transcriptomes, clonotype
研究通过人工合成gRNA骨架进一步拓展Cas12b/C2c1基因编辑工具盒
近年，CRISPR基因编辑技术及其相关应用成为生命科学领域备受关注的热点研究方向。基于这种技术，科学家们可高效、快速、便捷地对感兴趣的基因进行编辑，在基础科研、农业和医学的发展中具有重要应用。中国科学院动物研究所研究团队此前报道开发出基于CRISPR-Cas12b/C2c1的第三种CRISPR基因组编辑工具。相比CRISPR-Cas9和CRISPR-Cas12a/Cpf1系统，Cas12b/C2c
Nature：大规模CRISPR/Cas9筛选鉴定出600个癌症基因靶标
2019年4月25日讯/生物谷BIOON/---在作为同类规模最大研究之一的一项研究中，来自英国剑桥大学韦尔科姆基金会桑格研究所和Open Targets等研究机构的研究人员利用CRISPR/Cas9技术破坏了来自30种癌症类型的300多种癌症模型中的每个基因，并发现了癌症存活所必需的数千个关键基因。他们随后开发出一种新的系统，对600个最有希望用于开发治疗方法的药物靶标进行优先排序。这些结果加快
外泌体组成的全新鉴定
细胞外囊泡(extracellular vesicles，EVs)是由细胞分泌的具有双层磷脂膜结构的囊泡小体，绝大多数细胞均可分泌。细胞外囊泡中可以携带蛋白质、脂质和核酸等多种生物活性成份，介导体内细胞间远程通讯【1】。根据大小分类，EVs可以分为直径小于200纳米的sEVs(small extracellular vesicles)和直径大于200纳米的lEVs(Large extr