空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。
2024-07-02
Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的RNA结构开关
该研究展示了RNA结构开关在基因表达调控中的重要性,并强调了开发新的RNA开关鉴定方法的必要性。未来,SwitchSeeker有望被应用于更广泛的转录组研究中,揭示更多关于RNA结构和功能的奥秘。
2024-07-20
Nat Methods | 田鲁亦/刘晓东团队系统性评估11种空间组学技术
通过评估,不同技术方案各有优劣,并且一些国产的技术平台的指标已经达到领先,凸显了中国在这一新兴领域的快速发展趋势。
2024-07-16
Journal of Advanced Research: 转录组关联研究为香榧仁油和脂肪酸的生物合成调控提供了新的思路
研究者构建了一个高完整性的基因组表达区参考序列。并对170个不同地方品种大田葵籽粒的10个脂肪酸和油脂性状进行了转录组参考关联研究(TRAS)。
2024-07-30
BBI:化疗或会扰乱乳腺癌患者机体的肠道微生物组功能
研究结果表明:1)化疗会诱导机体微生物组的破坏和炎症;2)由此所产生的微生物组干扰与认知功能下降和炎症发生有关;3)那些认知功能受损的患者拥有独特的化疗诱导微生物组的改变。
2024-07-06
Cell | Andrew Dillin课题组发现胞外基质调控线粒体及免疫激活新机制
经过一系列药物胁迫测试,作者发现TMEM2过表达的细胞对线粒体胁迫具有更高的敏感性,而TMEM2敲除的细胞则显示出更强的线粒体胁迫抗性。
2024-07-05
Mol Cell | 杜文静课题组报道ME2维持CD8+ T细胞的代谢稳态和抗肿瘤免疫力的重要功能
本研究表明,ME2的生理功能是维持CD8+ T细胞新陈代谢所必需的。这些发现共同凸显了 ME2 在 T 细胞生理和病理过程中的重要性。
2024-08-19