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空间学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法

该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。

2024-07-02

Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录中的RNA结构开关

该研究展示了RNA结构开关在基因表达调控中的重要性,并强调了开发新的RNA开关鉴定方法的必要性。未来,SwitchSeeker有望被应用于更广泛的转录组研究中,揭示更多关于RNA结构和功能的奥秘。

2024-07-20

Nat Methods | 田鲁亦/刘晓东团队系统性评估11种空间学技术

通过评估,不同技术方案各有优劣,并且一些国产的技术平台的指标已经达到领先,凸显了中国在这一新兴领域的快速发展趋势。

2024-07-16

Cell:科学家发现油酸竟可恢复健康的阴道微生物

油酸(oleic acid)——人体内最丰富的脂肪酸之一,能在细菌性阴道病实验室模型中恢复阴道微生物的健康平衡。

2024-08-29

Journal of Advanced Research: 转录关联研究为香榧仁油和脂肪酸的生物合成调控提供了新的思路

研究者构建了一个高完整性的基因组表达区参考序列。并对170个不同地方品种大田葵籽粒的10个脂肪酸和油脂性状进行了转录组参考关联研究(TRAS)。

2024-07-30

BBI:化疗或会扰乱乳腺癌患者机体的肠道微生物功能

研究结果表明:1)化疗会诱导机体微生物组的破坏和炎症;2)由此所产生的微生物组干扰与认知功能下降和炎症发生有关;3)那些认知功能受损的患者拥有独特的化疗诱导微生物组的改变。

2024-07-06

Cell | Andrew Dillin课题报道线虫生殖腺调控组织间线粒体应激通讯

这篇论文提出了一种被脂质代谢信号所调控的组织间通讯模型。

2024-07-06

Cell | Andrew Dillin课题发现胞外基质调控线粒体及免疫激活新机制

经过一系列药物胁迫测试,作者发现TMEM2过表达的细胞对线粒体胁迫具有更高的敏感性,而TMEM2敲除的细胞则显示出更强的线粒体胁迫抗性。

2024-07-05

Mol Cell | 杜文静课题报道ME2维持CD8+ T细胞的代谢稳态和抗肿瘤免疫力的重要功能

本研究表明,ME2的生理功能是维持CD8+ T细胞新陈代谢所必需的。这些发现共同凸显了 ME2 在 T 细胞生理和病理过程中的重要性。

2024-08-19

Cell:泛癌症蛋白质基因学或有望揭示癌症治疗性靶点蓝图

本研究者的目的是更好地理解已知药物靶点的特性,希望能识别出新的靶点从而帮助开发新型药物。

2024-07-08