Nat Biotechnol:科学家通过利用新型算法分析肿瘤的遗传组成 有望准确测定癌症的进化机制
文章中,研究人员详细了一种新型在线资源,其或能帮助科学家们选择最佳的算法进行肿瘤进化的分析,同时还能增强对肿瘤的诊断准确性和疗法计划。
2024-06-21
消除取向优势问题的冷冻电镜三维重构新算法获得进展
科研人员利用SIRM方法,对几种带有缺失锥的数据集进行处理。结果显示,使用SIRM方法后的重建图像在缺失锥方向上的分辨率得到提高,恢复了取向优势带来的密度畸变问题,并提升了分辨率。
2024-08-08
一天两篇Cell:西湖大学闫浈团队揭示叶绿体蛋白转运动力机制与进化多样性
为了解答这一难题,科学家们尝试了包括免疫共沉淀、交联质谱、遗传敲除等策略,但至今未能完全揭示马达的真面目。要确定谁是马达的金标准,便是找到能与转运系统TOC-TIC直接相互作用,共同协作的蛋白。
2024-09-03
来自5万年前尼安德特人的守护:清华大学刘万里团队等揭示IgG1进化及其在抵御病原体中的作用
研究团队的一系列交叉学科的研究结果,揭示了宿主遗传变异作为疾病表型的影响因素的重要性,特别是在新发SARS-CoV-2传染病和其他人类历史上的感染事件中的潜在作用。
2024-09-13
Cell | 隐翅虫“生化武器”进化的基因组学与细胞基础
研究人员通过基因组组装、比较基因组学、进化树构建、细胞特异性转录组学等方法对隐翅虫的防御性腺体的分泌特征以及进化特征进行了刻画,并对隐翅虫与蚁类共生体这一高复杂性的分泌特征进行检测。
2024-07-18
Nat Eco Evo | 吴法柏/Bernheim团队揭示从古菌到真核的免疫蛋白进化
Viperin(干扰素诱导内质网关联病毒抑制蛋白)是人类先天免疫系统的成员,直接参与到病毒防御中。
2024-07-16
CRM:哈佛/斯坦福团队借助全新算法,找到调节CD8+T细胞抗癌战斗力的新通路!
GMDF算法的优势在于既可以进行跨数据库、跨瘤种的Meta分析寻找共享性特征,也可以分析特定“场景”,例如单一瘤种或根据患者性别、年龄等特征来做定制分析。
2024-07-06
Nat Biotechnol | 揭开肿瘤亚克隆演化之谜:31种算法在模拟肿瘤中的表现评估
为了更好地理解肿瘤的演化过程,研究人员开发了许多基于高通量测序技术的亚克隆重建算法。这些算法利用肿瘤DNA测序数据中的突变特征来推断肿瘤亚克隆的组成和演化历史。
2024-06-13