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PNAS:科学家发现能促进人类结直肠癌亚型发生的特殊转录因子

来自约翰霍普金斯大学Kimmel癌症研究中心等机构的科学家们通过研究发现,特定转录因子的表达或许在这个基因组的DNA甲基化程度中发挥着核心的角色,从而就会促进这些癌症不同亚型的发展。

2023-08-15

研究人员开发出定量蛋白质学数据的下游分析与可视化工具

基于超高分辨率液质联用质谱的定量蛋白质组学已成为重要的生命科学研究手段。与其他组学方法一样,恰当的数据分析流程是蛋白质组学研究的关键。基于质谱的蛋白质组数据具有方法仪器多样、搜库定量软件繁多的特点,导

2023-09-08

Advanced Science:韩敬东团队开发转录数据空间重构新算法

该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录

2023-06-21

猪遗传育种创新团队提出猪基因选配新方案

近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所猪遗传育种科技创新团队在猪基因组选配研究方面取得了新进展,提出了新的基因组选配方案,相关研究成果在线发表在《动物科学与生物技术(Journal of Animal

2023-08-21

单细胞转录测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式

这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角

2023-05-17

eLife:肠道收缩或会影响机体微生物的组成

来自加利福尼亚大学等机构的科学家们通过研究调查了是否肠道收缩会反过来影响肠道微生物组的组成。

2023-08-17

Nat Biotechnol:肠道微生物可增加HIV和EBV的感染风险和疾病严重程度

在过去的十年中,肠道微生物组引起了人们的极大兴趣。近期的研究已表明,肠道中的细菌和其他微生物在免疫、新陈代谢、消化以及抵御试图入侵我们身体的“坏细菌”方面发挥着辅助作用。然而,

2023-08-23

Science:肠道微生物通过促进宿主肠道细胞释放Snhg9 lncRNA分子对抗高糖高脂肪饮食引起的体重增加

在一项新的研究中,来自美国德克萨斯大学西南医学中心和中国浙江大学的研究人员发现,生活在肠道中的细菌会抑制一种限制脂肪吸收量的分子,从而导致喂食高糖、高脂肪饮食的小鼠的体重增加。这一研究成果最终可能会带

2023-09-04

空间转录数据多模态可视化工具研究取得进展

目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。

2023-06-05

Cell:中国科大朱书课题揭示蛋白Gasdermin D在小肠对食物的免疫耐受中的作用

肠上皮细胞(intestinal epithelial cell)是宿主细胞与大量外来抗原之间的主要屏障;目前还不清楚肠上皮细胞如何诱导针对病原体的保护性免疫,同时保持对食物的免疫耐受。在一项新的研究

2023-08-22