《Science》破解基因组“暗物质”的复制密码：首次看清LINE-1逆转录转座子侵染DNA的分子瞬间
该研究展示了人类 LINE-1 TPRT 复合物的四个冷冻电子显微镜结构，揭示了开放阅读框 2 蛋白（ORF2p）的构象动态及其对 TPRT 启动的靶 DNA 的广泛重塑。
2026-02-23
Cell：张元豪等团队重构癌症基因组认知：ecDNA驱动癌基因融合转录本产生，成为肿瘤进化的核心引擎
该研究表明ecDNA是在不同癌症类型中产生和扩增癌基因融合转录物的主要平台。
2026-01-13
Nature：转录与基因组双重视角解析人脑衰老的分子轨迹
衰老并未改变细胞身份，但代谢与翻译相关的“管家基因”在40岁后普遍下调，核糖体和线粒体功能衰退，抑制性神经元活动性削弱。
2025-10-02
Cell Res ：复旦大学陈海泉/石乐明/金力通过多组学手段揭示肺腺癌逐步发展的基因组和转录组动力学
该研究突出了LUAD逐步发展过程中的关键分子变化，为确定新的治疗靶点提供了见解，并有助于确定该疾病的治疗时间窗。
2025-12-07
Science：陈飞等团队开创细胞记忆新维度：基因编码系统TimeVault实现活细胞内转录组的长期稳定存储与回溯
该研究提出TimeVault，一个基因编码系统，记录和存储转录组在活的哺乳动物细胞为未来读取。
2026-01-17
Cell子刊：转录因子的"染色质画笔"，复旦大学陈飞等利用转录因子的"染色质画笔"：
该研究建立 配对的患者来源的类器官，用于研究乳腺癌如何从原发肿瘤演变为转移肿瘤。该研究揭示了驱动肿瘤进展的基于染色质的调节状态，并揭示了促进转移扩散的转录因子，为癌症演变和潜在的治疗漏洞提供了新的见。
2026-03-23
Nature：从基因组伤痕到转录组静默——单细胞多组学揭示大脑衰老的因果链条
研究为我们提供了一张前所未有的高分辨率地图，以前所未有的深度和广度，揭示了人类大脑在从婴儿期到百岁高龄的漫长旅程中，细胞层面发生的深刻变革。
2025-09-06
王思远团队开发单分子分辨率、覆盖全基因组的空间转录组学新技术
该研究开发了 RAEFISH，这是一种基于图像的空间转录组学新方法，具有全基因组覆盖范围和完整组织中的单分子分辨率，从而解决了现有空间转录组学技术普遍存在的“鱼与熊掌不可兼得”的困境。
2025-10-05
Cell：化学重编程与转录因子重编程“分道扬镳”——p53从“抑制者”变身“守护者”，保障CiPSC基因组完整性与高效诱导
研究揭示了化学重编程中p53的完全相反的作用：p53是化学重编程所必需的，并且p53的保留能够保障基因组完整性，同时防止过度的上皮-间充质转化（EMT）。
2026-04-28
Nat Genet：从脑图谱到肿瘤微环境：同济大学王晨飞/张鹏开发新工具让高分辨率空间转录组“看清每一个细胞”
该研究提出了Cellist——一种整合图像与表达信息的新型多模态细胞分割方法，能够实现全面的细胞层面分析。
2026-06-20