Nat Biotechnol：开发出混合宏基因组装配器OPERA-MS，更准确地组装复杂的微生物群落
2019年8月6日讯/生物谷BIOON/---通过高通量宏基因组测序已实现了对微生物组的表征。然而，现有方法并不是将来自短读取技术和长读取技术的读取片段结合在一起。在一项新的研究中，来自新加坡国立大学、新加坡基因组研究院、新加坡陈笃生医院、南洋理工大学和克罗地亚萨格勒布大学的研究人员开发出一种称为OPERA-MS的混合宏基因组装配器，它将基于装配的宏基因组聚类与重复识别的精确支架结合在一起，以准确
研究揭示DNA提取方法对浮游生物群落研究结果的影响
浮游生物是湖泊与水库生态系统的重要组成部分，在物质循环、污染物降解和水体自净等方面发挥基础和关键作用。浮游生物具有个体小、丰度高和极其复杂多样的特点，导致其难观测、难定量和难分析。长期以来，浮游生物群落生态研究严重依赖显微观测技术，随着高通量DNA测序技术的发展和应用，微型浮游生物群落的研究迎来了一个崭新的黄金时期。目前，DNA条形码技术已经发展成为研究微型浮游生物群落的常规方法之一。越来越多的研
Ritter制药RP-G28增加肠道微生物群 治疗乳糖不耐受
3月12日，通过调节肠道微生物群进行胃肠道疾病创新疗法开发的美国制药公司Ritter公布称，其主要在研药物RP-G28在377例乳糖不耐受患者的2b期研究中，达到了促进肠道微生物群有益适应的作用。该药物同时也是公司的重点开发项目，希望其成为FDA批准的首个乳糖不耐受治疗方案。北卡罗来纳大学教堂山分校医学副教授Andrea Azcarate-Peril博士在一份报告中表示：RP-G28可以修饰28种
华北平原麦田土壤微生物群落构建研究取得进展
生物群落如何构建是生态学中的核心问题之一，生态学家对植物的群落构建过程已进行大量研究，然而在微生物群落构建方面的研究则相对滞后。当前，土壤微生物生物地理学主要关注微生物的空间分布格局及其驱动因子，而对不同空间尺度下微生物的群落构建过程研究较少。基于此，中国科学院南京土壤研究所褚海燕课题组于2014年11月在华北平原麦田采集243份土壤样品，样点之间跨度最大为1092公里。利用高通量测序与生物信息分
微生物群落稳定性研究获进展
中国科学院生态环境研究中心中科院环境生物技术重点实验室邓晔研究组，在微生物群落的稳定性机制研究方面取得进展，为微生物多样性与生态系统功能关系的理解提供了新见解，研究结果在线发表在Molecular Ecology上。宏观生态系统中生物多样性和生态系统稳定性的关系理论已讨论多年，但将这一理论应用于微生物生态系统中的适宜性实验较少，原因是环境微生物样本复杂度高、物种多样性高、难以处理。因此，探究群落的
中科院城市环境所在微型浮游生物群落研究方面取得进展
浮游生物是湖库生态系统的主要组成部分，在物质循环、污染物降解和水体自净等方面发挥基础和关键作用。水库微型真核浮游生物（0.2-200 μm）包括原生动物、藻类、低等真菌和小型后生动物等，具有个体微小、种类多样
AJPGLP：食物和抗生素或会改变机体微生物群落 进而诱发肠易激综合征
日前，一项发表在国际杂志the American Journal of Physiology—Gastrointestinal and Liver Physiology上的综述文章中，来自梅奥诊所的研究人员表示，机体胃肠道中微生物群落的改变或许是诱发肠易激综合征（irritable bowel syndrome，IBS）的原因。
揭秘双胞胎肠道微生物群落和肠道免疫力发育的关联
近日，来自华盛顿大学医学院的研究人员对双胞胎从出生到2岁时进行研究发现，双胞胎儿童机体中肠道免疫系统的发育同肠道中数以万亿的微生物菌群的发育是同步的，相关研究刊登于国际著名杂志Nature上，该研究或为理解婴幼儿机体的健康生长发育提供一定思路，同时也为阐明多种机体免疫障碍，比如炎性肠病、食物过敏等疾病的发病机制提供研究基础。
Mol Metabol：饮食多样性降低或影响机体肠道微生物群落的多样性
过去50年里人类耕种方式的改变导致了农作物多样性的降低，从而导致人类饮食多样性的降低，而饮食丰富度的改变对人类健康的明显影响就是如今科学家们非常热衷于研究的课题；近日一项刊登于Molecular Metabolism杂志上的报告中，来自路易斯安那州立大学潘宁顿生物医学研究中心（Pennington Biomedical Research Center）的研究人员就阐明了他们的最新研究成果。
J Virol：肠道微生物群落如何影响HIV进展
HIV或许是一种肠道疾病，这种概念容易让我们忽视该病因性传播和血液传播的特性，而实际上HIV感染并且杀灭的是CD4+细胞，而大约三分之二的T细胞都位于肠道中的淋巴组织中，在那里HIV就会繁殖扩散。近年来对血液的研究得到了越来越多科学家们的关注，因为血液可以在全身不断循环，而肠道似乎难以到达，研究者们仅能够通过侵入性的方法来对其进行研究，而更好地理解肠道的环境或许可以帮助深入理解疾病的发病机制。