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EMBO J:揭示TRP14是细胞内半胱氨酸还原的限速酶,调节蛋白质半胱氨酸化

长期以来,TRP14一直没有明确的功能。本项研究不仅明确了它在半胱氨酸代谢中的作用,还有助于解释它在不同物种间的进化保守性。

2024-07-08

Science:科学家开发出能帮助理解人类基因转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27

Cell Mol Immunol丨吴励课题揭示调控树突状细胞发育与生存的重要机制

该研究首次报告了TRIM33通过促进Irf8表达以支持cDC1发育,同时通过抑制Bcl2l11在所有DC亚群及其前体中的表达,在维持DC的稳态中起到关键作用。

2024-06-14

M2巨噬细胞参与幽门螺杆菌感染诱导的二先天淋巴细胞活化

本研究强调M2巨噬细胞有助于幽门螺杆菌感染中ILC2的激活,研究者证明幽门螺杆菌感染可诱导巨噬细胞IDO高表达和M2极化,巨噬细胞随后分泌TSLP并最终激活ILC2。

2024-05-28

Cell Discov | 上海交通大学范先群等合作通过单细胞测序描绘了转移性结膜黑色素瘤的肿瘤结构并增强了临床决策能力

本研究首次报道了CoM的组织结构和独特的TME,并通过将scRNA-seq数据整合到癌症治疗决策中提供了新颖的概念。

2024-06-21

Science:新研究追踪癌细胞起源中的基因加倍

在这项新研究中,这些作者仔细观察了数千张单细胞在细胞分裂过程中的图像。他们开发了发光生物传感器来标记名为细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的细胞酶。

2024-05-21

Nature子刊:诸颖团队开发空间转录语义注释新算法Pianno

在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。

2024-04-10

Nature Genetics | 多维度解析复杂人类疾病:整合群体遗传学、干细胞生物学与细胞基因

hPS细胞作为一种细胞模型,在评估人类遗传变异对不同谱系、发育状态和细胞类型的影响方面显示出巨大的潜力。

2024-05-22

李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录的影响

本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术,探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。

2024-04-12

细胞和空间转录中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21