大脑中的“园丁”与“杂草”Nature：利用空间转录组时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应
这项研究表明，细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性，在塑造衰老过程中起着关键作用。
Nature Methods：形态学数据与人工智能的交响曲——“细胞绘图”的无限可能
“细胞绘图”技术的未来充满希望。随着批次效应校正、数据整合和实时成像等领域的持续突破，这一技术将进一步推动生命科学的前沿研究，成为从基础生物学到临床医学的关键工具，为健康和科学探索开辟更多可能性。
Nature：科学家揭开基因“功能组”奥秘，利用在线资源描述了2万多个人类基因的功能
如今这一最新的里程碑在知识库中能提供一种新的资源，并利用进化模型来使这一工具更加强大；这种方法就能允许研究人员将收集自人类基因的实验数据与模式生物（比如小鼠和斑马鱼）中相关基因中获得的数据相结合。
Nature Neuroscience封面论文：贺永团队创建人类一生中大脑功能连接组发育图谱与参考标准
该研究系统解析了人类大脑功能网络发育的关键里程碑及其时空演化规律，绘制了脑功能网络在整个生命周期的参考图表，填补了脑功能领域缺乏参考常模的空白。
Neurol Neuroimmunol Neuroinflamm：机体肠道微生物组的改变或与多发性硬化症的患病风险密切相关
本文研究结果表明，对肠道微生物的扩增子序列变异（ASVs，amplicon sequence variants）的分析或能揭示多发性硬化症患者机体免疫调节所诱导的分类菌株的变化。
Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱，CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异，还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹，绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
Ann Rheum Dis：肠道微生物组变化与临床明显的类风湿关节炎发病有关
类风湿性关节炎高危人群的肠道微生物组成与众不同，包括但不限于过量的普雷沃氏菌（Prevotellaceae）。这种微生物特征是一致的，并与传统的风险因素相关。
模拟5亿年进化，从头创造出全新荧光蛋白，重新点亮生物学
ESM3 是一款向生命科学领域的前沿人工智能语言模型，也是第一个同时对蛋白质的序列、结构和功能进行推理的生成式人工智能模型，它提升了我们利用生命密码进行编程和创造的能力。
《肝脏病学》：饿醒巨噬细胞！华科团队首次发现，短期饥饿通过改造巨噬细胞，重振抗肿瘤免疫
这个研究揭示了短期饥饿增强抗肿瘤免疫的新机制，为短期饥饿联合免疫检查点抑制剂治疗肝癌提供了新思路。
Mol Cell：HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子
HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域，从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制，最终激活多个癌症驱动基因，驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。