打开APP

Advanced Science:韩敬东团队开发转录数据空间重构新算法

该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录

2023-06-21

空间转录数据多模态可视化工具研究取得进展

目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。

2023-06-05

多篇文章解读科学家们在空间多组研究领域取得的新进展!

革命性算法BANKSY或能重塑空间组学数据分析、单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得重大进展、综述文章揭示单细胞和空间组学技术在肝脏研究领域的重要进展

2024-04-30

科研人员开发表观转录数据聚类框架iMVP

iMVP的开发为RNA编辑修饰研究带来了新的可能性,为科研人员提供了一个更全面、更有效的工具,有望有助于更深入地理解RNA编辑修饰的复杂性和功能。

2023-10-13

科研人员发表关于单细胞和空间技术在肝脏领域应用的综述文章

该文章介绍了多种前沿单细胞组学实验技术和空间组学实验技术并总结了常见的应用场景,剖析了这些新兴技术应用于肝脏样本可能产生的问题及潜在的实验或计算生物学解决方案。

2023-07-20

研究人员利用光催化邻近标记技术揭示应激颗粒转录动态变化

应激颗粒是在胁迫条件下形成的动态结构,通常认为其中包含翻译被抑制的RNA以及翻译元件,并可在刺激消失后解聚,是细胞内典型的无膜细胞器。

2023-12-04

空间几何约束诱导细菌与宿主细胞粘附的力学生物机制研究方面取得新进展

该研究不仅阐明了空间几何约束微环境调控细菌-细胞界面粘附的力学生物学机制,也为抗生素辅剂的筛选和临床上改善细菌抗生素治疗方案提供了可借鉴的思路和策略。

2024-02-15

Nat Aging | 华中科技大学王世宣/栗妍/戴俊揭示人类卵巢衰老的时空转录变化及FOXP1的调控作用

该研究提出了一个时空图谱,系统地描述了在卵巢生命周期的三个代表性阶段人类卵巢衰老的空间原型和细胞异质性:生殖年轻(18-28岁),中年(36-39岁)和老年(47-49岁)。

2024-04-11

学习啦《RNAscope™助力实现空间多组多靶标原位检测》

生物谷&梅斯医学联合Bio-Techne旗下子品牌ACD携手于2023年9月5号下午14:00-15:30举办“RNAscopeTM助力实现空间多组学多靶标原位检测”主题空中讲坛

2023-08-29

大鼠和人类胰岛转录中发现2型糖尿病前期的标志

中国科学院数学与系统科学研究院李雷课题组开发了一种计算方法,对T2D的动物模型Goto-Kakizaki(GK)和对照模型Wistar(WST)大鼠胰岛的时间序列全基因表达谱以及来自捐献者的人类胰岛的

2023-10-11