升级版环形RNA数据库网站发布
近日,国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康院)中科院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCpedia v2: An Updated Database for Comprehensive Circular RNA Annotati
科学家发表抗艾滋新成果 早期临床数据积极
9月26日,艾滋病领域迎来了好消息:来自Rockefeller大学的科学家们同时在《Nature》、《Nature Medicine》期刊发表了两项早期临床试验成果——组合两种广泛性中和抗体(bNAb),能够抑制艾滋病病毒长达4个月,远远长于现有药物。抗逆转录病毒疗法(ART)是目前HIV治疗的“黄金标准”,在临床试验中几乎是完美的。得益于这类药物的优化,艾滋病现已发展成一
Cancer Immunol Res:科学家有望利用大数据分析来预测癌症患者对免疫疗法的反应
2018年8月14日 讯 /生物谷BIOON/ --如今在大数据时代,癌症研究人员开始寻找多种新方法来监测癌症免疫疗法的有效性;近日,一项刊登在国际杂志Cancer Immunology Research上的研究报告中,来自约翰霍普金斯大学医学院的研究人员通过研究开发出了一种利用生物信息学的新方法,该方法或能作为一种新型工具帮助确定患者的免疫系统如何对癌症免疫疗法产生反应,以及如何有效识别机体自身
科学家开发出集合人类血液中化合物的可视化数据库!
2018年1月5日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一项刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上的研究报告中,来自日本东北大学的研究人员通过收集5000名志愿者的血液样本,开发出了集合血液代谢物的数据库,目前该数据库将免费提供给全世界的研究人员。图片来源:www.thoughtco.com代谢产物和蛋白质能够控制机体内部多个生理学过程,同时还能阐明细胞和其周围环境之间的相互
中国科学家构建首个创伤后应激障碍遗传学数据库
创伤后应激障碍(Posttraumatic stress disorder,PTSD)发生在创伤事件暴露后,是具有复杂病因的综合征。美国2013年公布的第五版《精神障碍诊断与统计手册》中,PTSD已从“焦虑障碍”组移到新的分组“创伤和应激相关障碍”中。经历创伤事件是罹患PTSD的必要条件之一,关于全球创伤事件暴露的流行病学研究表明,70%的受访者至少报告了一例创伤事件,但其中只有少数人
中国科学家发布表观基因组数据库MethBank 3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Research上。Methbank 3.0整合了大量DNA甲基化数据。作为表观修饰的重要组成部分,DNA甲基化
科学家揭示整合单细胞和群体细胞转录组数据推断细胞分化时间的作用
近日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)马普计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组,中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组,与清华大学沈沁研究组合作发表的论文,以Inference of differentiation time for single cell transcriptomes using cell population reference data为题,在线发表
首个全球人群基因组多样性和祖源信息数据库发布
11月3日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果,以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human populations为题,在线发表在《核酸研究》上。该研究分析了涵盖全球范围107个国家的356个人类
英国顶级专业期刊《核酸研究》发表史上最强翻译组学数据库
11月3日,英国Oxford出版社核心生物期刊Nucleic Acids Research(《核酸研究》,最新影响因子10.162)发表了承启生物联合创始人张弓等共同完成的基于云计算分析平台的TranslatomeDB数据库,文章标题为“Translatome DB: a comprehensive database and cloud-based analysis platform for tr
复旦大学发表首个人类血液外泌体长链RNA数据库
最近Nucleic Acids Research杂志在线发表了首个人类血液外泌体长链RNA数据库exoRBase(www.exoRBase.org),收录了上万条环状RNA(circRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA。该数据库由复旦大学附属肿瘤医院/肿瘤研究所(复旦肿瘤所)黄胜林课题组完成,这是该课题组继2015年Cell Research首次报道环状RNA富集于外泌体并存在于血