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多层级的图神经网络推动蛋白质功能预测的发展

高通量测序的进展推动了蛋白质序列数量的快速增长。尽管如此,由于实验研究需要较长的周期并且费用昂贵,大部分蛋白质序列缺乏功能注释。因此,具备自动而准确推断蛋白质功能的计算方法变得至关重要。

2023-08-17

Nat Cardiovasc Res:一种此前功能未知的蛋白质或在人类先天性心脏畸形发生过程中扮演关键角色

来自苏黎世联邦理工学院等机构的科学家们通过对遗传修饰小鼠进行实验后发现了参与法洛四联症发生的分子开关,并确定了如何调节这些开关来减缓损伤心脏的畸形改变。

2023-11-28

研究发现ASK1-K716R通过保护血脑屏障完整性减少创伤性脑损伤后神经炎症和白质损伤

本研究利用Crispr /Cas9系统构建了携带位点特异性突变的ASK1 Map3k5-e (K716R)的转基因小鼠,采用控制性皮质撞击法制备TBI模型,发现ASK1-K716R不改变小鼠体内 AS

2023-11-17

科学家鉴定出1800多种突触蛋白质,并定义18种不同的突触类型

研究者们描述了纹状体多巴胺能神经突触和皮质GABA能神经突触三种亚型的蛋白质组学特征,并强调了这些突触蛋白质之间的功能差异。

2023-11-06

研究人员开发出定量蛋白质组学数据的下游分析与可视化工具

基于超高分辨率液质联用质谱的定量蛋白质组学已成为重要的生命科学研究手段。与其他组学方法一样,恰当的数据分析流程是蛋白质组学研究的关键。基于质谱的蛋白质组数据具有方法仪器多样、搜库定量软件繁多的特点,导

2023-09-08

肿瘤新纪元:从基因组学向蛋白质组学再次跃进

泛癌症研究的重点是确定不同癌症的分子特征。该研究扩展了之前以基因组学为中心的泛癌症研究,结合蛋白质组学层来阐明癌症驱动因子的六个关键方面

2023-08-17

博士期间已Nature+Science在手,年仅30的她再发Science,揭示全新的蛋白质降解机制

总的来说,这项研究发现的Midnolin-蛋白酶体途径,可能代表了蛋白酶体绕过传统的泛素化系统来实现许多核蛋白选择性降解的通用机制。

2023-09-12

Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高

与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任

2023-10-17

Cell Systems封面论文:曾坚阳团队提出蛋白质口袋结构表征新方法

具体而言,对于输入的蛋白质结构,首要任务是确定其表面上anchor的位置。这些anchor位置是通过对蛋白质表面潜在结合配体的空间区域进行采样、过滤、聚类等操作后得到的。

2023-08-21

Nature | 由数千种蛋白质组成的最大数据集是人类健康研究的标志性一步

2023年10月4日,《自然》杂志发表了一篇世界上规模最大、最全面的研究成果,该研究涉及常见基因变异对血液中循环蛋白的影响以及这些关联如何导致疾病。通过将生物样本转化为英国生物库的数据,这项史无前例的

2023-10-12