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Advanced Science:韩敬东团队开发转录组数据空间重构新算法

该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录

2023-06-21

人类大脑的形状竟能影响它的工作方式

一个多世纪以来,科学家们一直认为确定我们的经验、希望和梦想的大脑活动模式是由不同的大脑区域如何通过由数万亿个脑细胞连接组成的复杂网络相互沟通决定的。

2023-06-06

空间转录组数据多模态可视化工具研究取得进展

目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。

2023-06-05

Nature最新研究:首次证实大脑整体形状对大脑功能的影响远大于复杂的神经元连接!

什么样的孩子聪明?爷爷奶奶辈会觉得拥有大脑勺的孩子长大后更聪明,‘大脑勺的孩子脑容量大,脑容量大,孩子自然会更聪明’。为了让孩子变得“聪明”,很多人试图

2023-06-08

江华苦茶初生和次生代谢产物在不同成熟度叶的空间分布研究取得新进展

茶叶所茶叶品质化学与营养健康课题组吴文亮博士后在江华苦茶初生和次生代谢产物在不同成熟度叶的空间分布研究取得了新进展。相关研究成果以《Comprehensive metabolic analyses p

2023-06-07

Nature:揭示黏连蛋白、CTCF和DNA张力在染色体空间组装中的作用

在一项新的研究中,来自荷兰代尔夫特理工大学和奥地利维也纳生物中心的研究人员发现在我们的细胞核中,两种蛋白复合物承担着染色体空间组装的主要责任,而DNA张力在其中起着令人惊讶的作用。

2023-04-26

Nature子刊:李婧翌团队开发用于单细胞多组学和空间组学的数据模拟和统计推断的多功能模拟器scDesign3

总的来说,scDesign3是一个多功能套件,用于基准测试计算方法和解释单细胞和空间组学数据。

2023-05-15

Nature子刊:戴磊团队开发SEER-FISH成像技术,解析微生物组空间结构

该研究发展了一种可容错编码的序贯荧光原位杂交(SEER-FISH)技术,用于解析复杂微生物群落的空间结构。

2023-03-20

Cell:在单细胞分辨率下揭示小鼠大脑衰老的分子和空间特征

在一项新的研究中,来自美国哈佛大学的研究人员的新发现为我们提供了炎症与随着年龄增长而经历的认知障碍之间的关系的新见解,并表明这可能是一种细胞链式反应的结果。相关研究结果近期发表在Cell期刊上。

2023-02-20

空间多位点测序为肝癌异质性评估和患者免疫分型提供新思路

近日,上海交通大学医学院附属仁济医院肝脏外科/肝移植中心杭化莲团队和上海市肿瘤研究所王存团队合作在《Genome Medicine》

2023-02-20