The Plant Cell:普通小麦亚基因组非对称调控机制研究中取得进展
普通小麦(Triticum aestivum L.)是经两次远缘杂交而形成的一种异源六倍体作物,含有A、B和D三个亚基因组。亚基因组分化对多倍体小麦基因组可塑性具有重要贡献,且成为其成功驯化的关键因素之一。然而,决定小麦亚基因组分化的时空特异性调控机制尚不清楚。中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员薛勇彪研究组和中国科学院分子植物科学
Genome Biol & Sci Adv:基因组的3D结构或会影响机体膀胱癌和儿童脑癌的进展
2021年6月9日 讯 /生物谷BIOON/ --儿童高级别胶质瘤(pHGGs,Pediatric high-grade gliomas)包括多形性胶质细胞瘤(GBM)和扩散型内因性脑桥神经胶质瘤(DIPG,diffuse intrinsic pontine glioma),其均是病态的脑部肿瘤;即使患者经过治疗,其生存率仍然很低,这就使得pHGGs成为了引
Journal of Genetics and Genomics:揭示古老棉种蓬蓬棉的基因组分化特征
近日,中国农业科学院棉花研究所棉花资源创新利用创新团队利用遗传学和全基因组关联分析等方法,系统地研究了一种在我国南方的多个海岛生长了数百年的陆地棉多年生半野生棉——蓬蓬棉,揭示了其进化地位,为拓宽陆地棉遗传多样性提供了理论依据和材料基础。相关研究结果发表在《遗传学与基因组学杂志(Journal of Genetics and Genomics)》上。据团队首
鹦鹉螺基因组测序分析揭示针孔眼形成和生物矿化机制
近日,中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室喻子牛团队首次在国际上完成了鹦鹉螺全基因组测序,揭示了这种古老软体动物的进化规律、针孔眼形成和生物矿化机制。相关研究成果以论文“The genome of Nautilus pompilius illuminates eye evolution and biomineral
Frontiers in Plant Science:大豆突变体基因定位测序方法改良研究获进展
随着新一代测序技术的发展和全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)成本的不断下降,基于WGS的分离群体分组分析(Bulk Segregation Analysis,BSA)已成为快速定位候选基因的常规工具,但已报道的方法仍有待完善。例如,依赖于自交系杂交的QTL-seq策略需要后期耗费大量精力进行精细定位;而基于突变体的Mut
基因组新数据预示濒危秃鹰有美好未来
曾经数量繁多的加州秃鹰在野外短暂地“灭绝”了,到1982年仅有22只人工饲养的秃鹰存活于世。但好消息是,今天,有300只秃鹰在野外自由翱翔,另有200只被圈养。发表在Cell Press细胞出版社旗下期刊Current Biology(《当代生物学》)上的一项关于加州秃鹰基因组的新研究,发现这种动物已经有了数量惊人的遗传多样性。该研究
Nat Neurosci:全基因组CRISPR筛查揭示神经元在氧化性压力状况下得以存活的关键机制
2021年5月28日 讯 /生物谷BIOON/ --单细胞转录组学能提供不同人类细胞中基因表达的系统图谱,而下一项挑战则是系统性地理解细胞类型的特定基因功能,基于CRISPR的功能基因组学和干细胞技术的整合则能使得分化的人类细胞中的基因功能得到扩展化的分析。当细胞中的单个基因被开启或关闭时,其存在或缺失会影响细胞的功能和生存;日前,一篇发表在国际杂志Natu
利用全基因组测序揭示CRISPR / Cas9在葡萄上的脱靶效应
近日,Horticulture Research在线发表了西北农林科技大学葡萄种质资源与育种团队王西平课题组题为“Whole genome sequencing reveals rare off-target mutations in CRISPR/Cas9-edited grapevine”的研究论文。青年教师王现行与涂明星博士为该
因美纳向全球病原体基因组计划捐赠6000万美元测序设备
2021年4月28日,因美纳(纳斯达克股票代码:ILMN)携手比尔及梅琳达·盖茨基金会及其他公共和私营机构,承诺为全球病原体基因组计划捐赠价值6,000万美元的测序设备。该计划是2020年10月宣布的非洲病原体基因组计划(Africa PGI)的扩展,将有助于在全球范围内构建一个全面的病原体基因组网络,在需要帮助的地区构建关键的公共卫生管理能力。
高精度亚洲猪参考基因组图谱绘制完成
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物基因工程与种质创新科技创新团队联合北京相关生物企业等单位成功绘制了梅山猪高质量基因组图谱。该图谱是迄今为止精度最高的亚洲猪基因组图谱,为我国地方猪种质资源保护和开发利用奠定了基础。相关成果发表于《分子生态资源(Molecular Ecology Resources)》。据项目负责人周荣博士介绍