Nature:科学家构建基因表达调控DNA序列进化和适应度景观研究框架
顺式作用元件是位于基因旁侧序列中能影响基因表达的非编码DNA序列。这些顺式作用元件的突变可能影响与基因转录因子相互作用,从而调控基因表达,进而改变生物表型和适应度景观。一个完整的适应度景观由一个适应度函数定义,该函数将序列空间中的每个序列映射到其相关的适应度。但调控DNA序列与适应度建立的映射关系很难可靠地推广到整个序列空间,因此构建完全的适应度
Neurobiol Dis:揭示阿尔兹海默病患者大脑中基因表达改变的分子机制
来自西班牙的科学家们通过对来自近800名已故个体的大脑样本的遗传数据进行分析,识别出了确定患病的个体大脑中星形胶质细胞和神经元中的基因表达与未诊断为痴呆症的个体(对照个体)的大脑中细胞中基因表达之间的差异,这些样本来自西奈山医学院等三家机构。
CIRC-ZEB1通过吸附miR-199a-3p促进PIK3CA的表达并影响肝癌细胞的增殖和凋亡
尽管随着诊断技术和治疗方法的进步,肝癌患者的预后有所改善,但肝癌的转移性和复发率以及患者的5年和10年生存率仍然不令人满意。因此,需要更准确的诊断指标,能够及早发现肝癌,有效改善患者的预后。
EB病毒依赖促进PD-L1表达诱导免疫逃逸机制
EB病毒(Epstein-Barr virus, EBV)是最早发现的人类肿瘤病毒,与鼻咽癌(NPC)、胃癌(GC)及多种淋巴瘤的发生发展密切相关。世界上90%以上的成年人都感染此病毒,通过建立EBV与免疫系统之间的平衡变成持久性潜伏感染。EBV感染与肿瘤免疫逃逸密切相关,EBV蛋白产物可通过调控PD-L1的表达促进免疫逃逸。EBV被
Cell:揭示多种神经退行性疾病都存在TMEM106B原纤维
在一项新的研究中,来自美国哥伦比亚大学、科罗拉多大学博尔德分校和加拿大英属哥伦比亚大学等研究机构的研究人员揭示了患病大脑中的一种新的原纤维,即一种由通常忙于清洁细胞的蛋白形成的原纤维。
Science:杏仁基底外侧核中的多巴胺分泌促进大脑进入快速眼动睡眠状态
在一项新的研究中,来自日本筑波大学和中国北京大学生命科学学院的研究人员发现杏仁基底外侧核(basolateral amygdala)中多巴胺的产生与快速眼动(rapid eye movement, REM)睡眠的启动之间存在关联。相
张锋团队胜诉,被认定为发明了CRISPR真核基因编辑
在围绕CRISPR基因编辑技术的专利纠纷中,美国专利商标局做出了有利于张锋所在的博德研究所团队的裁决。美国专利商标局已经确定博德研究所团队是第一个发明CRISPR-Cas9来编辑人类细胞并用于制造药物的团队,而不是诺奖得主 Jennifer Doudna 和 Emmanuelle Charpentier 所属的CVC团队。这一裁定指出
Toxicol Sci:空气污染或会通过影响胎盘中的基因表达对女性妊娠产生不利影响
来自德州农工大学等机构的科学家们通过对实验模型进行研究分析了空气污染对胎儿发育的影响效应。他们分析了暴露于不同浓度的超细颗粒物(UFPs,ultrafine particles)对胎儿发育的影响,以及这种暴露如何影响胎盘中某些基因的表达。
Computational and Structural Biotechnology Journal:基于人工智能预测模型实现异源蛋白的高水平表达
近日,生物所微生物蛋白设计与智造团队与国内外多家科研单位开展合作,成功构建人工智能预测模型MPEPE,基于深度学习和分子进化的策略模拟分析异源基因在大肠杆菌中表达,提高了异源蛋白在大肠杆菌中的表达量。该研究促进了对基因序列与蛋白可溶性表达之间关系的认识,并为酶蛋白的理性分子设计提供了新方法。相关研究成果发表在《计算与结构生物技术期刊(Computationa