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Nat Genet:单细胞分析解开结直肠癌细胞的神秘面纱!

结合单细胞基因组学和计算机技术,一个研究团队(包括来自杰克逊实验室(JAX)单细胞生物学主任Paul Robson博士在内)鉴定出了11种结直肠癌肿瘤的癌细胞组成及邻近的非癌细胞,这对于更好地肿瘤靶向诊断和治疗很重要。

2017-03-26

单细胞基因组突变检测新突破

 爱因斯坦研究人员已经开发并验证了一种准确识别单细胞基因组中突变的方法。这种新方法可以帮助预测癌症是否将在看似健康的组织中发展,在今天的自然方法的在线版本中发表的论文中被描述。相应的作者是Lola和Sa

2017-03-22

Nat Methods单细胞基因组突变检测取得突破性进展

近日来自爱因斯坦医学院的研究人员宣布开发并验证了一种能够准确鉴定单细胞基因组基因突变的新方法,相关研究发表在Nature Methods上,文章通讯作者为Jan Vijg博士,他是爱因斯坦医学院遗传学系主任和分子遗传学Lola and Saul Kramer主席。

2017-03-26

单细胞测序应用及技术实例

作为“在单个细胞水平上对基因组进行测序”的单细胞测序技术能够解决上述难题。与传统的全基因组测序相比,单细胞测序不仅测量基因表达水平更加精确,而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA,其优势是全方

2017-03-08

青岛能源所发明简易高效的单细胞分选与测序对接技术

为了满足考察自然界中细胞"原位功能"这一共性科学需求,"现场"、"实时"的单细胞分选与测序已成为生命科学装备研制领域的一个重要发展趋势。尽管第三代测序技术已实现仪器微型化,但与测序对接的单细胞精准分选装备却

2017-02-27

Oncotarget:对白血病研究常用细胞系进行测序 提高结果重复性

“突变是生命的一部分。基因中的突变就像文本信息中的排印错误,但究竟哪些突变会引发癌症?这是个问题。如果没有好的模型系统对突变进行检测就无法解决这一难题。”Watanabe-Smith博士这样说道。

2017-02-28

Nat Methods:开发出基于CRISPR/Cas9和单细胞RNA测序的CROP-seq方法

在一项新的研究中,来自奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Christoph Bock及其团队开发出一种新方法:将CRISPR集中筛选和按序筛选(arrayedscreen)的优势结合在一起。通过将CRISPR基因组编辑与单细胞RNA测序整合在一起,他们在单个实验中研究上千个细胞,从而能够平行地确定多种基因的调控影响。

2017-01-23

单细胞研究促生肌腱干细胞生物学新见解

目前对于肌腱干细胞的认知定义局限于来源于肌腱具有类似与间充质干细胞的多项分化能力,尚无特异识别标志和亚群界定。单细胞基因分析技术突破了传统群体细胞研究平均化的局限,将其利用于肌腱细胞的亚群解析,显示了nestin在肌腱干/祖细胞的一个亚群中富集,这激发研究人员进一步研究在肌腱分化和损伤修复过程中nestin在肌腱干细胞中的表达和功能作用。

2017-01-10

Cell:将CRISPR和单细胞RNA测序结合在一起分析基因功能

在一项新的研究中,来自以色列魏兹曼科学研究所等机构的研究人员在一种方法中将两种强大的研究工具--- CRISPR基因编辑和单细胞基因组分析---结合在一起,从而可能最终有助我们解答这些问题和更多的其他问题。

2016-12-18

Cell:垃圾RNA细胞应激反应中发挥重要作用

在一项新的研究中,来自美国麻省总医院的研究人员发现了之前被认为是非功能性的“垃圾”RNA分子的一种意想不到的作用:控制细胞对应激作出的反应。

2016-12-18