研究人员提出一种用于鉴定微量样品m6A的高效便捷建库测序技术
中山大学生命科学学院骆观正教授团队提出一种用于鉴定微量样品m6A的高效便捷建库测序技术，鉴定到数千个高重复性m6A位点，为促进m6A功能研究提供方法学创新。N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine， m6A) 是真核生物mRNA中含量最丰富的碱基修饰类型，动态调控mRNA的剪接、定位、降解等多种代谢通路，进而参与细胞分化、肿瘤发生、免疫反应等重
Science：利用新型机器学习技术准确预测蛋白和RNA的三维结构
美国斯坦福大学博士生Stephan Eismann和Raphael Townshend在该大学计算机科学副教授Ron Dror的指导下，利用巧妙的新型机器学习技术，开发出一种通过计算预测准确结构来克服这一问题的人工智能算法。最值得注意的是，即使只从少数已知结构中学习，他们的方法仍然成功，这使得它适用于那些结构最难通过实验确定的分子类型。
Nature Communications：RNA二级结构测序新技术解析Dicer结合与切割底物的RNA结构基础
RNA结构是RNA的调控与功能的基础。过去科学家们使用X-ray晶体衍射、NMR、冷冻电镜等生物物理的手段，解析了许多RNA三维结构，揭示了RNA发挥不同功能的结构基础。随着二代测序技术的发展，研究者结合化学修饰与高通量测序开发了许多高通量探测全转录组RNA二级结构的技术，并应用于RNA结构与RNA相关调控的功能研究中，揭示出RNA结
Science：利用RNA-SPLIT技术揭示Xist RNA的动态变化
2021年6月24日讯/生物谷BIOON/---哺乳动物中的X染色体失活（XCI）使得XX雌性相对于XY雄性的X连锁基因表达水平相等。XCI过程由非编码RNA Xist（X 染色体失活特异性转录物）控制，它在需要失活的X染色体中表达，在那里顺式积累并招募基于染色质的基因沉默所需的因子。顺式限制在单个染色体区域的分子基础尚不清楚，但人们认为这涉及特定的Xist
Cell Rep：基于类器官的高通量RNA测序有助于寻找治疗结直肠癌的药物
大肠癌（CRC）是当今世界上确诊率最高的3种癌症之一，也是与癌症相关的发病率和死亡率的主要原因之一。尽管近年来癌症疗法在不断地发展，但针对晚期和转移性肠癌患者仍然缺乏有效的治疗方法，因此迫切需要基于药物的新型疗法。
环形RNA数据挖掘新技术研究获进展
中国科学院北京生命科学研究院研究员赵方庆团队在Nature Biotechnology上发表了题为Comprehensive profiling of circular RNAs with nanopore sequencing and CIRI-long的论文，研究内容为高效测定环形RNA全长转录本的实验和计算方法。该研究主要是利用
揭示利用新开发的ExSeq测序技术高分辨率确定RNA在细胞中的位置
2021年1月29日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国麻省理工学院和哈佛医学院的研究人员利用一种新的组织扩张技术，设计了一种方法，对组织样本中的信使RNA（mRNA）分子进行标记，然后对mRNA进行测序。相关研究结果发表在2021年1月29日的Science期刊上，论文标题为“Expansion sequencing: Spatially
单细胞测序技术如何助力人类多种疾病的研究？
本文中，小编盘点了科学家们发表的多篇重要研究报告，共同解读他们如何利用单细胞测序技术来助力人类多种疾病的研究，分享给大家！ 【1】Nat Med：单细胞测序揭示胃癌患者差异化结局的原因doi：10.1038/s41591-020-1125-8近日，一项刊登在国际杂志Nature Medicine上的研究报告中，来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研
我国科学家开发新技术，极大提高单细胞测序性能
单细胞全基因组测序（WGS）对于表征DNA中动态细胞间变化至关重要。当前用于单细胞WGS的样品制备技术复杂，昂贵，并且存在高扩增偏差和误差。厦门大学杨朝勇团队在Science Advances 在线发表题为“Digital-WGS： Automated， highly efficient whole-genome sequ
RNA+DNA同时测序 可检测癌症组织中的基因融合和碱基突变
当前的研究表明，诸如NTRK(神经营养因子受体酪氨酸激酶)等罕见的融合变异事件能有效地驱动肿瘤发生，并成为多种肿瘤中靶向治疗的靶标。基于DNA检测的大Panel可以覆盖几百个癌基因，是大规模探测突变的强有力工具，但在融合/重排检测方面仍具有一定挑战。靶向二代测序是一种能够综合鉴定癌症生物标志的方法，根据不同的变化情况，起始的检测材料可为DNA或