Nature：开发出一种计算T细胞的新工具 或能快速预测癌症患者对疗法所产生的反应
2021年9月13日 讯 /生物谷BIOON/ --免疫微环境会影响肿瘤的进化，其既能预测患者的预后还能预测患者对免疫疗法的反应；然而，对肿瘤浸润性淋巴细胞（TILs）的测定往往会因缺乏合适的数据而受限，DNA的全外显子组测序（WES）经常被用来计算肿瘤的突变负担和识别可操作的突变。近日，一篇发表在国际杂志Nature上题为“Using DNA sequen
Nat Biotechnol：新型计算方法CoNGA为预测T细胞行为奠定基础
研究人员开发出一种称为CoNGA的新型计算方法，它可能有助于人们关注将T细胞受体（TCR）基因序列和T细胞功能相关联在一起的隐藏生物模式。此外，利用CoNGA，他们可以分析从单个T细胞中收集到的复杂数据，以揭示新的T细胞群体，并揭示塑造T细胞发育的TCR特征。
“双酶担载的纳米杂化凝胶模拟过氧化物酶体用于肿瘤化学动力/光动力学治疗”取得最新进展
近日，国际权威学术期刊Nature Communications杂志以“Peroxisome inspired hybrid enzyme nanogels for chemodynamic and photodynamic therapy”为题，在线报道了华东理工大学材料科学与工程学院李永生教授、牛德超副教授研究团队和同济大学化学科
Cell子刊：经过化学修饰的gRNA可将CRISPR-Cas13在人细胞中的靶向效率提高2至5倍
2021年8月11日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，美国纽约大学和纽约基因组中心的Neville Sanjana博士及其团队为靶向RNA而不是DNA的CRISPR系统开发出经过化学修饰的向导RNA（gRNA），这是拓展基因修饰及其表达水平的最新努力。这些经过化学修饰的gRNA极大地增强了在人类细胞中靶向---追踪、编辑和/或敲降（knockdo
云南咖啡化学及品质研究取得新进展
阿拉比卡豆作为咖啡饮料的原料，可以生产非常优质的咖啡饮料，使其成为最具经济价值的品种，在全世界范围内被广泛种植。咖啡主要种植范围介于南北回归线之间的热带国家，例如巴西、埃塞俄比亚、哥伦比亚、越南、印尼等。随着咖啡消费市场的不断扩大，中国云南也逐渐成为全国乃至全球阿拉比卡咖啡的重要原料生产基地而进入国内外市场。中国科学院昆明研究所邱明华团队一直致力于云南小粒咖
EclinicalMedicine：新型计算机成像分析工具或能识别出致死性肺部疾病新亚型
2021年7月22日 讯 /生物谷BIOON/ --众所周知，特发性肺纤维化（IPF，Idiopathic pulmonary fibrosis）和特发性胸膜肺弹力纤维增生症（PPFE，pleuroparenchymal fibroelastosis）患者的预后不佳，但对这些形态学过程之间的关联的预后意义却缺乏相应的检查和分析。近日，一篇发表在国际杂志Ecl
Science：利用新型人工智能软件工具RoseTTAFold仅需10分钟就可准确地计算出蛋白质三维结构
2021年7月17日讯/生物谷BIOON/---自从DeepMind在2020年的“结构预测关键评估（Critical Assessment of Structure Prediction）”（CASP14）会议上展示了该领域的显著进展以来，科学家们已经等待了数月，以获得高度准确的蛋白质结构预测的机会。现在等待已经结束。在一项新的研究中，来自美国多个研究机构
研究人员揭示连接沉水植物中枢性状和生态系统功能的化学计量和生理学机制
水体富营养化引起的营养富集和水下光照可利用性减少影响了水生生态系统的结构和功能，导致浅水湖泊发生稳态转换，因此探索影响淡水生态系统结构和功能的机制十分重要。富营养化通过改变水体光和营养的可利用性影响沉水植物的功能性状，如化学计量特征和生理状态。然而，目前尚不清楚连接沉水植物功能性状和生态系统结构和功能的机制，以及这些机制如何引起沉水植物的衰退。近日，中国科学
研究人员通过理论计算揭示XimE环化酶催化的二分特性
近日，美国化学会催化领域顶级期刊《ACS Catalysis》在线刊发了上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室教授赵一雷团队在酶催化分子机制研究上取得的最新进展，“Computational Exploration of How Enzyme XimE Converts Natural S-Epoxide to Pyran and R-Epo
EMBO J：一种促进DNA修复的特殊蛋白或会增强化学疗法的治疗效率
2021年6月21日 讯 /生物谷BIOON/ --内源性醛类或化疗制剂所诱导的DNA链间交联（DNA ICLs）能够干预诸如复制和转录等基本过程，范可尼贫血通路（Fanconi Anemia pathway）对链间交联的识别和修复需要形成X形DNA结构，其可能是由两个复制叉在交联处或由一个复制叉穿过病灶而产生。化疗能通过促进肿瘤组织损伤从而杀灭肿瘤细胞，而