Nat Biotechnol && J Comput Biol:开发出新算法对单细胞基因组进行测序
2012年8月13日 讯 /生物谷BIOON/ --美国加州大学圣地亚哥分校计算机科学家Pavel Pevzner领导的一个国际研究小组开发出一种新的算法来对有机体单个细胞的基因组进行更加快速地和更加准确地测序。这个新的算法被称作SPAdes,能够被用来对不能利用标准克隆技术进行处理的细菌进行测序,其中研究人员将这些细菌称作生命的暗物质,比如医院中发现的一些病原体,在深海或人胃肠道中存在的细菌。
分光谱分析及光谱分析仪器的原理与分类
摘要:众所周知,光谱分析是基于物质中的原子和分子处于不停的运动状态,这种物质内部运动,在外部可以以能量辐射和吸收的形式反映出来,这种形式就是电磁辐射。而光谱就是按着波长顺序排列的电磁辐射。由于原子和分子的运动是多种多样的,因此光谱及光谱分析仪器的种类也是多种多样的。
JCO:最新肺癌分类系统述评
肺癌小活检及细胞学样本相关术语及标准 在2013年2月11日出版的《临床肿瘤学杂志》(Journal of Clinical Oncology)杂志上,美国纪念斯隆凯特琳医院的William D. Travis博士等人发表了一篇述评文章,对最新版肺癌分类系统进行了探讨。该文部分摘译如下。
Blumea:朱华等植物分类学研究获进展
朱华研究员基于20多年对茜草科粗叶木属植物的调查、分类鉴定和研究经历,对泛马来西亚地区该属植物进行了分类学研究,确定有131个种,5个亚种和6个变种,在研究中新发现了41个新种,3个新亚种和3个新变种。这些新植物种分别来自印度尼西亚、马来西亚婆罗洲、马来半岛、菲律宾、巴布亚新几内亚及所罗门群岛等。 粗叶木属植物约有200个种,为全热带分布属, 以亚洲热带地区为种多样性中心。
Genome Biology:成功开发基因融合检测算法SOAPfuse
华大基因成功开发出一种基因融合检测算法SOAPfuse。该算法具有准确率高、敏感性强、精度高、资源消耗少等优点,主要采用局部穷举算法和一系列精细的过滤策略,来对基因融合进行快速、精确的检测。SOAPfuse的最新研究结果已于2013年2月14日在《基因生物学》(Genome Biology)杂志上在线发表。 基因融合是指染色体上两个异位的基因嵌合在一起,形成一个嵌合基因的现象。
Nat Biotechnol:科学家开发出一种可预测癌症药物敏感性的新型算法
近日,刊登在国际著名杂志Nature Biotechnology上的一篇研究论文中,来自赫尔辛基信息技术研究所的科学家通过研究开发了一种新型算法,该算可以及基于细胞的基因组数据来帮助预测乳腺癌细胞系对药物的敏感性。