Nature:用条形码标记基因组中的顺式调控元件提供了对人类基因组的深入了解
在这项研究中,这些作者基于大规模实验数据,开发了几种机器学习模型来预测顺式调控元件(CRE)的调节活动。
2025-01-20
研究提出准确识别基因组间直系同源共线性的新方法
中国科学院昆明植物研究所研究员马永鹏团队联合国际、国内科研机构开发了直系同源指数(OI),以度量共线性的直系同源水平,其定义为种间共线性区块内直系同源基因的占比。
2025-05-02
汪阳明团队创新双组学技术MAPIT-seq:在单细胞水平同时绘制RNA结合蛋白作用图谱与基因表达图谱的新利器
MAPIT-seq在检测互作图谱的同时可以同步获取转录组信息,实现功能结合与表达背景的双重解析。
2025-08-17
Cell:我国科学家在真核细胞中实现百万碱基的精确基因组编辑
关键技术突破包括:成功整合长达18.8 kb的大片段DNA、完成5 kb DNA序列的完全替换、实现12 Mb染色体倒位、4 Mb染色体删除以及全染色体易位。
2025-08-29
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-23
研究揭示宿主基因组趋同是地下哺乳动物适应穴居生活的趋同演化基础
该研究从多组学视角探讨了地下哺乳动物适应洞穴环境的适应性演化和趋同演化机制,阐明地下哺乳动物穴居适应的趋同演化是由宿主基因组趋同而非肠道微生物组趋同驱动,为地下哺乳动物的适应性演化和趋同演化提供新认识
2025-08-26
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nature Genetics:基因组淘金热!LDAK-KVIK如何打破遗传分析中的“速度与精度”魔咒?
LDAK-KVIK 的强大,不仅体现在最终的输出结果上,更体现在其设计过程中的诸多“智慧思考”。
2025-08-20