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Science:新研究开发出一种基于DNB阵列构建的空间分辨高通量单细胞转录平台

Stereo-cell建立了一个具有空间和多模式能力的高通量单细胞转录组学整合框架。该平台克服了现有方法的关键限制,提高了分析细胞间相互作用、微环境和亚细胞基因表达的可扩展性、灵活性和精确度。

2025-08-26

Nature:从基因伤痕到转录静默——单细胞多组学揭示大脑衰老的因果链条

研究为我们提供了一张前所未有的高分辨率地图,以前所未有的深度和广度,揭示了人类大脑在从婴儿期到百岁高龄的漫长旅程中,细胞层面发生的深刻变革。

2025-09-06

Nature Methods:当百年病理学遇见AI——iSCALE赋能H&E图像,预测细胞空间转录

iSCALE 的诞生,为研究人员提供了一种全新的“世界观”和方法论,彻底改变了我们在大尺度上探索组织微观世界的游戏规则。

2025-09-18

Cancer Cell:黄活聪团队通过单细胞空间分析,揭示抗原呈递癌症相关成纤维细胞的“双重身份”及其空间生态位

该研究通过单细胞分辨率空间分析,揭示了抗原呈递癌症相关成纤维细胞(apCAF)包含了两个截然不同的亚群——间皮样 apCAF(M-apCAF),另一种是纤维细胞样 apCAF(F-apCAF)。

2025-10-01

王思远团队开发单分子分辨率、覆盖全基因空间转录学新技术

该研究开发了 RAEFISH,这是一种基于图像的空间转录组学新方法,具有全基因组覆盖范围和完整组织中的单分子分辨率,从而解决了现有空间转录组学技术普遍存在的“鱼与熊掌不可兼得”的困境。

2025-10-05

Nature Genetics:陈万泽团队开发单细胞转录因子测序技术,剖析转录因子剂量对细胞重编程异质性的影响

该研究开发了 scTF-seq技术,实现了剂量敏感的大规模基因扰动单细胞组学,并以转录因子介导的细胞重编程为模型,系统揭示了基因剂量在细胞命运调控中未被充分认识的多层次、非线性复杂效应。

2025-10-06

Nature Methods :“等深度”模型重塑空间生物学格局!深度学习与空间转录学的完美结合

GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。

2025-02-01

中国学者一作Nature论文:绘制转移性胰腺癌转录可塑性空间图谱

不同患者的原发灶与其多器官转移灶之间缺乏统一的克隆进化模式,即使在同一器官内部,也可观察到多个独立克隆亚群的共存。此外,癌细胞的谱系表型与其克隆起源无严格对应性,而是显著地与其所处的肿瘤微环境相关联。

2025-04-27