David Baker团队开发新型AI蛋白设计模型——LigandMPNN，实现原子上下文条件蛋白序列设计
研究团队开发了一种新型深度学习方法——LigandMPNN，该方法明确地对生物分子系统中的所有非蛋白质成分进行了建模。
MAPIT-seq，同时绘制单细胞RBP-RNA互作图谱与表达谱
研究人员开发了一项名为MAPIT-seq的新技术，它如同一位能潜入细胞内部的“分子侦探”，不仅能精确绘制出特定RBP在原位与哪些RNA分子发生了接触，还能同时拍下整个细胞的基因表达“全景图”。
Nature Biotechnology：线性mRNA的逆袭——病毒元件A7使其稳定性媲美环状RNA，翻译效率却遥遥领先
从近20万个病毒基因片段中，筛选出了一系列能够显著增强mRNA稳定性和翻译效率的“魔法序列”。其中一个名为A7的元件，它赋予了线性mRNA堪比环状RNA的超长“待机时间”，同时蛋白质表达效率却远超后者
《自然》证实：Z-RNA 靠亿年病毒残余识毒，细胞自毁断感染，抗癌有戏
新研究表明，人类细胞并非对这种病毒破坏行为束手无策。它们将转录终止的破坏识别为一种警报信号，激活"自我毁灭程序"并牺牲自身——甚至在病毒能在其中增殖之前。这使得它们能将感染的传播扼杀在萌芽状态。
Nature：刘一团队揭示病毒RNA逃避宿主对遗传密码子偏好性调控的翻译机制
病毒RNA翻译之所以可以逃避宿主对密码子使用的调控，是因为病毒5′UTR阻断了mRNA的环化，使其翻译不再依赖密码子使用。
生物学专属ChatGPT来了：对话式AI智能体——ChatNT，能够理解DNA、RNA和蛋白质语言
名为 ChatNT的多模态对话智能体，能像生物学家一样，“读懂” DNA、RNA 和蛋白质的序列信息，并用自然语言（英语）与你对话，直接回答你关于生物分子的各种专业问题。
Nat Methods：史偈君团队开发三代测序检测RNA修饰的算法基准平台，为多种修饰检测提供权威指南
该研究构建了高质量、单碱基分辨率的基准数据集作为“金标准”，并从准确性、生物学合理性、跨样本泛化能力及计算效率四个维度出发，设置了十余项评估指标。
Nature系列综述：赵方庆团队综述 AI 驱动的环状RNA发现
这篇综述总结了 circRNA 的发现、表征和功能分析算法方面的最新突破，还探讨了整合大规模 circRNA 测序数据所面临的挑战，并探索了人工智能（AI）驱动算法在未来的发展潜力。
清华大学最新Cell论文：娄智勇/饶子和团队发现冠状病毒复制模板循环与RNA加帽的协同机制
该成果重构了对病毒转录复制过程的认识体系，结束了对冠状病毒解旋酶极性、加帽机制等问题长达 25 年的争论。
中山大学张锐教授团队开发MIRROR，显著提高RNA编辑效率
实验结果表明，MIRROR gRNA的编辑效率最高可达传统gRNA的5.7倍，在小鼠体内实现了超过80%的编辑效率。