Nature系列综述：乔治·丘奇绘制 AI 蛋白质设计路线图，逐步指导利用AI工具设计蛋白质
该综述的核心是提供一个全面且可操作的蛋白质设计路线图，逐步指导如何将最先进的 AI 工具整合到蛋白质设计工作流程中，包括结构与功能预测工具以及用于从头设计的生成式模型。
2025-09-15
诺奖得主David Baker推出RFdiffusion3，颠覆蛋白质设计格局，开启全原子生物分子设计新时代
该研究提出了一种全原子扩散模型——RFdiffusion3（RFD3），实现了全原子生物分子相互作用的从头设计，能够在配体、核酸和其他非蛋白质原子簇的背景下生成蛋白质结构，其比前代方法更简单且更高效。
2025-09-23
南京大学最新Nature Chemistry论文：AI从头设计超稳定蛋白
该研究提出了一种可扩展且高效的计算设计策略，用于从头设计稳健的蛋白质，为理性设计在极端环境中具有抗性的蛋白质系统提供了一种通用方法。
2025-11-21
Cell重磅：AI从头设计生成小型结合蛋白，大幅提高先导编辑效率
在这项最新研究中，研究团队利用 RFdiffusion 来抑制错配修复（MMR）通路，从而提高先导编辑（PE）效率。
2025-08-07
Science：AI造“钥匙”，精准开锁癌细胞：深度学习开启蛋白设计新纪元
研究团队展示了一种颠覆性的策略，利用生成式人工智能(Generative AI)从零开始设计全新的蛋白质，这些蛋白质能像高精度的“分子巡警”，精准识别并锁定癌细胞或病毒感染细胞表面的独特“身份证”。
2025-08-03
Cell重磅：AI从头设计微型蛋白调控钠通道，逆转心律失常和癫痫
该研究首次通过人工智能（AI）从头设计出特异性靶向 NaV1.5 的微型调控蛋白——ELIXIR，可精准修复钠离子通道功能障碍，逆转相关心律失常和癫痫。
2025-08-23
David Baker团队开发新型AI蛋白设计模型——LigandMPNN，实现原子上下文条件蛋白序列设计
研究团队开发了一种新型深度学习方法——LigandMPNN，该方法明确地对生物分子系统中的所有非蛋白质成分进行了建模。
2025-04-01
我国学者发布首个通用分子设计世界模型ODesign，实现核酸/蛋白质/小分子等多形态分子的一键式设计
ODesign在小分子设计基准测试中显著优于系列基准模型，针对复杂的GPCR受体口袋可以一键设计出具备优质结合模式的小分子。
2025-11-05
攻克“不可成药”，David Baker团队中国博后利用AI从头设计蛋白，靶向内在无序蛋白，解锁治疗靶点
这两项研究中，研究团队采用了两种互补的设计策略，这两种策略基于氨基酸序列，而无需蛋白结构信息，因此，有助于在大量新的治疗靶点上实现高度通用的药物发现。
2025-07-20
David Baker最新论文：像拼乐高一样设计蛋白，可编程蛋白组装，解锁纳米材料新纪元
该研究利用人工智能（AI）工具，实现了 20 多种蛋白质笼、二维阵列和三维晶体的精准构建，成功率高达 10%-50%。
2025-08-04