研究人员发布耐脱水植物基因组数据库
通常情况下极端脱水对植物是致命的,但少数陆地植物在特殊的环境中演化出营养体耐脱水(Vegetative Desiccation Tolerance,VDT)的特性。
2023-12-25
Brief Bioinform | ChIP-GPT:改革生物医学数据库记录提取的大型语言模型
ChIP-GPT的设计旨在识别和提取关键元数据,例如染色质免疫沉淀(ChIP)目标和细胞系,从而支持大规模的生物医学分析。
2024-02-14
「如果PubMed、UK Biobank、TCGA 等数据库被禁用」中美科技脱钩,国内生物科研要被卡脖子了吗?
中美科技战终于打到了生物领域,我国的生物科研道路可谓路漫漫其修远兮。
2024-03-14
科学家构建涵盖五大植物类群的150+物种参考代谢组及数据库
植物“参考代谢组”是指一个植物物种所有代谢物的总和。一个植物物种“参考代谢组”与代谢物之间的关系,类似于植物物种“参考基因组”与基因之间的关系。
2023-12-04
研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics
近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组研究所(国家生物信息中心)章张、宋述慧团队,开发了大豆多维组学深度整合数据库SoyOmics。
2023-04-10
应晓敏/伯晓晨团队开发基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组学数据的马赛克整合
研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具——MIDAS,首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能。
2024-01-25
Nature子刊:李婧翌团队开发用于单细胞多组学和空间组学的数据模拟和统计推断的多功能模拟器scDesign3
总的来说,scDesign3是一个多功能套件,用于基准测试计算方法和解释单细胞和空间组学数据。
2023-05-15
Nature:剑桥大学徐宇/Michael Inouye构建出直接从基因型预测多组学数据的独特资源
在一项新的研究中,英国剑桥大学公共卫生与初级保健系的Yu Xu和Michael Inouye领导的一个国际研究小组构建了一种直接从基因型预测多组学数据的独特资源:OmicsPred。
2023-04-14
NAR:刘光慧/周园春/曲静/张维绮合作建立细胞谱系多组学数据库
细胞谱系形成和转化在哺乳动物整个生命周期中经历了复杂的转录和表观遗传改变。深入研究谱系分化、维持和退变有助于全面了解器官发育、稳态、衰老和疾病等重要生物学过程。
2022-11-04