空间转录组数据多模态可视化工具研究取得进展
目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。
Cell Host & Microbe:肠道微生物组的改变或与机体癌前结肠息肉的发生有关
来自MIT博德研究所等机构的科学家们通过研究将特定类型的肠道菌群与机体癌前结肠息肉的发生联系了起来。
研究发现MAGI家族蛋白的PDZ-GK超结构域是一种新型磷酸化蛋白识别模块
蛋白质的磷酸化/去磷酸化及其介导的蛋白复合物的组装/解离是细胞内信号转导的关键调控方式之一。磷酸化依赖的蛋白-蛋白相互作用通常是由磷酸化蛋白结合结构域介导。这些结构域包括14-3-3、FHA、MH2、
Cell子刊:刘星吟团队揭示肠道微生物代谢物吲哚-3-乳酸的抗肿瘤免疫新机制
该研究首次阐释了肠道微生物代谢物吲哚-3-乳酸通过调控染色质的可及性进而调控胆固醇代谢影响结直肠癌发生发展的表观遗传学机制,为肠道微生物介导的抗肿瘤免疫的表观遗传机制提供了全新的见解,为CRC患者的防
Nature:揭示染色体碎裂导致基因组重排的新机制
每个分裂细胞的目标是将它的基因组准确地分离到两个遗传上相同的子细胞。然而,在一项新的研究中,来自美国德克萨斯大学西南医学中心等研究机构的研究人员发现这一过程经常出错,并可能是癌症和先天性疾病中发现的一
Nature Cancer:全基因组CRISPR筛选,发现多发性骨髓瘤治疗新靶点
研究团队筛选到了一组几乎全新且独特的影响多发性骨髓瘤细胞脆弱性的基因,筛选到的这116个对多发性骨髓瘤生存至关重要的基因中只有少数在此前寻找多发性骨髓瘤基因突变或基因表达改变的研究中被发现。
三篇Nature和1篇Nature子刊发布史上首个人类泛基因组参考草图
来自美国加州大学圣克鲁斯分校等研究机构的研究人员发布了第一个人类泛基因组(pangenome)的草图,这是一个新的、可用的基因组参考,它结合了来自不同祖先背景的47个个体的遗传物质,从而可以更深入、更
Nature:“跳跃基因”或能改变人类结肠组织的基因组特征 从而有望揭示机体衰老和癌症发生的奥秘
来自韩国科学技术院等机构的科学家们通过研究针对人类大肠的完整基因组中的跳跃基因进行了一项突破性的研究。
我国科学家领衔发表8篇Science论文+2篇Science子刊以及1篇Nature子刊,通过灵长类基因组计划揭示灵长类动物进化的秘密
在中国浙江大学生命演化研究中心的张国捷(Guojie Zhang)教授、中科院昆明动物研究所的吴东东(Dong-Dong Wu)研究员、西北大学的齐晓光(Xiao-Guang Qi)教授、云南大学的于
3篇Nature论文连发:人类泛基因组首个草图公布
田纳西大学健康科学中心的 Erik Garrison 和同事观察了异源着丝粒染色体短臂(中节位于靠近染色体一端)间的重组模式,对一种过去曾推测存在但因缺乏合适数据未观测到的染色体之间的DNA交换机制提