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Nat Mach Intell:识别肿瘤新抗原-物理启发的Sliding-Transformer神经构架

PISTE算法将物理/生物的先验规则与数据驱动的神经网络框架有机结合,实现了全新的Transformer的注意力机制。

2024-10-02

Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性

利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。

2024-10-01

Nature:单细胞多组学研究揭示唐氏综合征儿童易患白血病的原因

这项单细胞多组学研究为唐氏综合征胎儿造血提供了高分辨率分子图谱,并表明唐氏综合征患者细胞基因组中存在显著的调节重构,从而导致他们易患白血病等血液学疾病。

2024-10-01

Nature:科学家揭示为何唐氏综合征患儿患白血病风险较高?

本文中,研究人员所提供的单细胞、多组学资源提供了唐氏综合征胎儿造血过程的高分辨率分子图谱,并揭示了导致共发生血液疾病的重要调控重组机制。

2024-10-01

Neuron:于国强团队倡议脑数据科学新发展

该研究讨论并总结了脑科学中的数据科学及其前景。脑科学研究时常依赖于大规模和复杂数据集。大数据集对理解神经系统具有重要作用,处理这些数据的关键在于建立稳健的数据基础设施和合适的数据科学分析方案。

2024-10-01

Nat Methods:瞿昆/黎斌/陈发来合作系统性评估单细胞多组学分析算法

结果显示,在蛋白质丰度预测方面,totalVI 和 scArches 表现最为优异;在染色质可及性预测中,LS_Lab 算法排名领先。

2024-10-01

杭州医学院金大智团队在艰难梭菌One Health物种间克隆传播研究中取得新进展

本研究首次发现ST35强大的芽孢形成能力不仅有利于其在各种环境中的生存,而且有助于人与动物(猪)之间的克隆内和种间传播。

2024-09-30

STTT:王福俤团队等揭示铁死亡和焦亡与心力衰竭的神秘关联

结果表明,ACSL4在压力超负荷诱导的心脏重构过程中通过铁死亡诱导的焦亡信号通路发挥着至关重要的作用。

2024-09-30

Mol Cancer:S100A6+肿瘤细胞在转移中至关重要,靶向肿瘤细胞和成纤维细胞之间的反馈回路是一种很有前途的抗转移策略

本研究建立了HCC的单细胞肿瘤异质性格局,并揭示了肿瘤细胞的三亚型分类。其中,S100A6+ EMT亚型具有以EMT上调和缺氧为特征的促转移表型,并伴有TGF-β-SMAD通路的激活。

2024-09-24

Nat Med揭示儿童肥胖的‘脂’命密码:脂质组学助力心脏代谢风险管理

本研究通过质谱分析对儿童和青少年的脂质谱进行分析,揭示了肥胖与多种脂质(如神经酰胺、磷脂酰乙醇胺等)的关联,并发现这些脂质与心脏代谢风险(如胰岛素抵抗、肝脂肪变性等)显著相关。

2024-09-22