从组成到功能:日渐深入的微生物组学研究
得益于高通量测序技术的飞速发展,如今已能系统、深入地解析微生物组与宿主/环境的紧密联系。通过微生物rRNA基因测序、宏基因组学和宏转录组学研究等方法,结合“全微生物组关联分析(MWAS)”的核心策略,能精准解码菌群组成谱、功能谱和表达谱,挖掘关键生物标记物,进而阐明“菌群——宿主——环境(生态系统)”之间复杂的互作机制和因果链。本报告将围绕微生物组大数据,全面探讨并阐述微生物组研究的具体策略、解析方法和最新进展。
修饰蛋白质组学研究思路及SCI文章解析
生物体中许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质的相关丰度控制,还会被各种时空特意分布、可逆的翻译后修饰调控,因此揭示翻译后修饰的发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。 蛋白质发生翻译后修饰时其分子质量会发生相应的改变,通过质谱能够精确测定蛋白质或多肽的分子质量。同时,发生翻译后修饰的蛋白质在样本中含量低且动态范围广,所以在质谱检测前需要对发生修饰的蛋白质或肽段进行富集。 本次课程中科新生命王文婕博士就“修饰蛋白质组学的研究思路及SCI文章解析”为题展开讨论,向大家介绍修饰蛋白质组学的技术方法及研究进展,以及在SCI文章中的实验设计思路。
单分子测序开启转录组学研究新时代
以基因测序技术发展为背景,阐述以第三代测序技术为核心的全长转录组测序与二代测序技术的转录组测序的差异,以及在研究基因结构等问题上所带来的巨大优势。并以经典案例为参考,阐述全长转录组测序在样品制备、实验设计及数据分析等环节的切入点和注意事项。
毛细管区带电泳-质谱技术应用于自下而上蛋白质组学研究
研究蛋白质组在不同生物状态下的动态变化对于阐明蛋白质在疾病发生与发展过程中的作用极其的重要。基于质谱的自下而上蛋白质组学方法已经被广泛的应用于各种生物问题的研究。在线反相色谱质谱(RPLC-MS)一般是蛋白质组学研究的首选技术。目前,基于RPLC-MS的自下而上蛋白质组学方法并不完美, 还有一些技术挑战亟待解决。 首先,大规模的准确的区分蛋白质变体 (protein isoforms) 非常困难,因为大多数蛋白质的鉴定仅仅是依赖于有限的几条肽段。进一步改进肽段分离的峰容量有望改善蛋白质变体的表征。其次,单细胞蛋白质组分析极具挑战,因为目前的RPLC-MS技术的灵敏度还相差甚远。发展更高灵敏度的蛋白质组学方法势在必行。毛细管区带电泳质谱技术(CZE-MS) 被认为是另一个自下而上蛋白质组学的重要工具,因为它可以实现高效的肽段分离以及高灵敏度的肽段检测。 在此次演讲中,将介绍应用新型超低流速鞘流液接口和离子源(深圳市永道致远科学技术有限公司CMP Scientific品牌EMASS-II ion source)的CZE-MS技术而开发的蛋白质组学方法,并对蛋白质组学的历史及其主要挑战和机遇,对如何提高CZE-MS对蛋白质组学的灵敏度和峰容量的方法进行讨论,和对基于CZE-MS的蛋白质组学的未来发展方向进行一些思考。
毛细管区带电泳-质谱技术应用于自下而上蛋白质组学研究
研究蛋白质组在不同生物状态下的动态变化对于阐明蛋白质在疾病发生与发展过程中的作用极其的重要。基于质谱的自下而上蛋白质组学方法已经被广泛的应用于各种生物问题的研究。在线反相色谱质谱(RPLC-MS)一般是蛋白质组学研究的首选技术。目前,基于RPLC-MS的自下而上蛋白质组学方法并不完美, 还有一些技术挑战亟待解决。 首先,大规模的准确的区分蛋白质变体 (protein isoforms) 非常困难,因为大多数蛋白质的鉴定仅仅是依赖于有限的几条肽段。进一步改进肽段分离的峰容量有望改善蛋白质变体的表征。其次,单细胞蛋白质组分析极具挑战,因为目前的RPLC-MS技术的灵敏度还相差甚远。发展更高灵敏度的蛋白质组学方法势在必行。毛细管区带电泳质谱技术(CZE-MS) 被认为是另一个自下而上蛋白质组学的重要工具,因为它可以实现高效的肽段分离以及高灵敏度的肽段检测。 在此次演讲中,将介绍应用新型超低流速鞘流液接口和离子源(深圳市永道致远科学技术有限公司CMP Scientific品牌EMASS-II ion source)的CZE-MS技术而开发的蛋白质组学方法,并对蛋白质组学的历史及其主要挑战和机遇,对如何提高CZE-MS对蛋白质组学的灵敏度和峰容量的方法进行讨论,和对基于CZE-MS的蛋白质组学的未来发展方向进行一些思考。
布鲁克-核磁共振在生物样本代谢组学研究中的新进展和新应用
作为生物样本代谢组学研究的两大利器之一,近年来核磁共振技术的发展,尤其是在高度自动化、标准化和精确定量等方面的突破,促进了代谢组学在慢病转化研究中的新应用。 本报告将分享Bruker Biospin最新发布的疾病诊断研究(IVDr)方案,包括一键式全自动地完成人体体液样本的核磁数据采集、代谢物定性定量和疾病诊断研究,并将分享在心脑血管疾病、癌症、遗传代谢病、精准营养和新冠肺炎中的重要应用。 敬请期待。
单细胞多组学研究与临床应用峰会前会之单细胞技术在发育生物学中的应用
一个受精卵是如何从单个细胞增殖、分化为大量不同类型的细胞、组织和器官,又是怎样生长、成熟,最终构成一个完整的个体的?这一直是发育生物学领域中一个很大的谜团。由于技术和方法的制约,这个谜团过去一直无法解开。在过去的数年时间里,科学家们利用常规的测序技术,但无法将关键信息从繁多的结果中有效提取出,而单细胞测序技术是以单个细胞为单位进行高通量测序,对其中的遗传信息进行分析,反映细胞间的异质性、研究多种动物中的发育过程。如今,单细胞测序技术结合计算生物学,已经可以描绘单个受精卵逐步发育分化的详细转录图谱,为人类解开受精卵发育分化之谜照亮了一线曙光。