苏健:肺癌标本库建设与转化医学研究
广东省肺癌研究所于2003年成立后,便着手筹建肺癌单病种肿瘤标本库,建立了大库容量、覆盖各种临床类型、连续动态观察的标本库。目前拥有近7000例,80 000多份包括肿瘤组织、癌旁组织、正常组织、血液、胸水等各类型标本。为加强标本库规范化、信息化管理,2010年开发了《临床医学标本管理系统》,与医院EMR及HIS系统对接,保证了数据信息的准确性。以标本库为支撑,广东省肺癌研究所开展了一系列肺癌转化医学研究,国内最早开展EGFR临床检测,第一次提出EGFR突变丰度与EGFR-TKI疗效相关的概念,明确我国非小细胞肺癌驱动基因突变谱,明确EGFR/ALK双变异流病特征等。
PacBio单分子超长测序-陈巍学基因(3)
Pacific Biosciences公司的单分子测序技术,最长的读长可达3万个碱基。是目前最长的测序技术。同时可以测到DNA上的甲基化修饰,测序的速度也很快。
本课程介绍了期测序的化学原理、芯片设计,优点、不足、限制因素。
孙孟红:病理学在生物样本库中的重要性
"病理学是基础医学与临床医学之间的桥梁"在生物医药飞速发展的今天,可以演变为"基础医学与临床医学、转化医学之间的桥梁"。病理医生是有高度职业道德和责任感的群体。生物样本库中疾病相关样本的收集、管理和分发离不开病理医生的参与。使样本的质量最大程度上保持与样本离体时的状态一致、将准确的信息提供给研究者,使样本成为基础和临床研究者手中宝贵的疾病相关材料,间接提供长期的、经得起考验的研究结果。随着肿瘤诊断水平的提高,早期发现的病例比率越来越高,使小标本、回归石蜡成为一种趋势;晚期、复发、转移病例活检组织获得的提倡,成为医疗、病理学、研究者之间共享有限样本的最佳形式。
基因投错票,导致肿瘤 - 陈巍学基因(4)
在人细胞的基因组中,多个与细胞生长有密切关系的基因,通过类似美国国会的分权体系组织起来,共同管理细胞的分裂、增殖过程。
当基因发生突变,并且打破了组织体系的平衡时,就会引发癌症。本视频介绍了这一体系。
基因投错票,导致肿瘤。-陈巍学基因(4)
在人细胞的基因组中,多个与细胞生长有密切关系的基因,通过类似美国国会的分权体系组织起来,共同管理细胞的分裂、增殖过程。
本课程介绍了当基因发生突变,并且打破了组织体系的平衡时,就会引发癌症。
无创产前检测 - 陈巍学基因(5)
基于高通量测序的无创产前检测,以其高准确率、无意外流产风险,这两个明显的优点,广泛应用在产前检测中。
本课程介绍无创产前检测技术,和其工作原理。
人全基因组测序 - 陈巍学基因(6)
随着Illumina HiSeq X10测序仪的上市,人全基因组测序成本降到一千美元以下。
本期课程介绍:
1、HiSeq X10的技术创新之处;
2、人全基因组测序数据能带来哪些有用的生物信息
上海国际医学园区
上海国际医学园区以先进医疗器械制造业和现代医疗服务业为核心并涉足医药研发、销售和生物医药服务外包等领域,以打造高科技医疗器械及生物医药产业基地和高端医疗服务平台为目标,力争建成一座科技领先、环境优美、生态和谐的现代化医学科学城。园区占地11.88平方公里。上海国际医学园区位于新浦东的中心位置,东临申江路,南依S32,西靠S3公路,北缘周邓公路。距离浦东国际机场18公里,虹桥国际机场25公里,地铁16号线在医院区西侧设有站点。自成立以来,园区就受到政府的大力支持,先后获得国家生物医药产业基地扩展区、国家医疗器械产业集群、国家科技欣贸创新基地、国家自主创新示范区等多项政府授牌和认可。特别在2011年,国家卫生部和上海市政府部市再度合作,联手共建上海国际医学园区建设联席会议,并出台一系列政策,将园区打造成全国范围内的医疗特区。
园区始终秉承着高起点、高标准的基础设施和服务平台建设,按照医学科技产业项目先行,逐步孕育培养现代医疗服务业的发展思路,截止2011年,园区已吸引了包括西门子、德尔格、安络杰,科文斯、上药集团、先声药业等医疗器械及生物医药知名企业百余家。在现代医疗服务产业方面,承接了公立医院改革所剥离的医疗特需服务,国内首家"建、管、用"分离模式的高端盈利性医院--"上海国际医学中心"已开工建设;此外上海市质子重离子医院、上海同济宝隆医院、上海伊丽莎白国际妇产医院、德舟国际医院等数家中外合资高端医疗机构相继入驻。
此外,园区积极搭建产业服务平台,整合资金流、技术流、信息流,构筑网格化的产业生态。园区引进上海医药高等专科学校、上海医疗器械高等专科学校、上海制药工程学院等培训机构和实训基地,为园区内的企业和医疗机构输送各类所需的人才;园区引进包括上海市医疗器械检测所在内的其他服务平台并提供配套服务;园区与国内外专业机构合作,举办国际水准的学术交流和专业论坛,及时传递医学领域最新动向,把握医学产业发展的脉搏。凭借着得天独厚的区位优势、专业的政策支持以及有效的政府沟通,上海国际医学园区将辐射上海及整个长三角地区,成为上海打造亚洲医疗中心城市的重要支撑。
RNA-seq方法和应用- 陈巍学基因(7)
NA-seq是高通量测序中最常见的一种应用。
本期课程介绍其:
1、方法原理;
2、生物信息分析,表达差异、火山图展示、聚类分析、GO、Pathway、可变剪接、融合基因、点突变
单细胞DNA测序 - 陈巍学基因(10)
从一个细胞做全基因组的测序,是很有用的分析手段。目前MALBAC方法和MDA方法是两个最主要的单细胞全基因组扩增方法。
本视频介绍了:1、MALBAC方法的原理,和其巧妙之处;2、MDA方法的原理;3、单细胞测序在胚胎植入前检测中的应用