吕雪梅:肿瘤内部和之间异质性的演化及其医学意义
介绍了肿瘤研究进展,提到了肿瘤异质性、细胞群体多样性和进化驱动力、肿瘤内部异质性。提出肿瘤内部多样性分析的关键是取样。肿瘤细胞存在于癌旁“非肿瘤”组织中的证据。
文路:肝癌异质性的单细胞三重组学分析及肝癌患者循环游离DNA甲基化组分析
介绍了单细胞三重组学测序技术,可以检测基因组拷贝数变异、DNA甲基化组和转录组.对一例肝细胞癌症分析,发现了两个细胞亚群。提到CpG岛异常超甲基化存在于几乎所有人类肿瘤。介绍了MCTA-Seq技术。
蛋白质组学在生命科学研究中的应用
本课程从宏观角度阐述蛋白组学技术在科研领域中如何更好的帮助科研人员解决问题,怎么做一个好科研,如何快速精准获得有创意的科研思路,蛋白组学技术有哪些,原理及流程,蛋白组学技术在各领域研究中的应用。 沈博还会与您分享如此高效高产的方法,如番茄工作法、时间管理、思维导图、Omnifocus、Calendar和印象笔记等在他科研和生活中的运用。
从组成到功能:日渐深入的微生物组学研究
得益于高通量测序技术的飞速发展,如今已能系统、深入地解析微生物组与宿主/环境的紧密联系。通过微生物rRNA基因测序、宏基因组学和宏转录组学研究等方法,结合“全微生物组关联分析(MWAS)”的核心策略,能精准解码菌群组成谱、功能谱和表达谱,挖掘关键生物标记物,进而阐明“菌群——宿主——环境(生态系统)”之间复杂的互作机制和因果链。本报告将围绕微生物组大数据,全面探讨并阐述微生物组研究的具体策略、解析方法和最新进展。
非酒精性脂肪性肝炎动物模型的药理学评价:组织病理和生物标记物
非酒精性脂肪性肝炎NASH是非酒精性脂肪肝的一种极端形式,其特征为肝脂肪导致的小叶炎症并随肝细胞损伤,进而引起肝脏纤维化,最终导致肝硬化以致肝细胞癌。其病理生理学发病原因是与最初肝细胞内脂质堆积有关,在联合第二个打击因素(有待进一步阐明)的刺激后,引发炎症和纤维化。目前在美国,非酒精性脂肪肝的发生概率在10-14%之间,而这其中会有10-30%的病人会转变为非酒精性脂肪性肝炎。目前在中国,非酒精性脂肪肝已经超过慢性病毒性肝炎,成为排名第一的肝脏疾病。临床诊断NASH的金标准则是肝组织活检和组织病理学评价。已经明确的NASH肝脏组织病理学特点包括脂肪变性、炎症、肝细胞凋亡和纤维化。用于估评研发药物体内药效的NASH动物模型应重现该疾病的二次击打病理生理学,及关键的组织病理特征。然而现有的脂肪肝及/或肝纤维化动物模型并不能完全满足人类NASH的病因学及/或组织病理学要求。 我们建立并验证了一个NASH动物小鼠模型,在该模型中,先以高脂饲料(HFD)诱导动物肥胖,然后用四氯化碳(CCL4)诱导纤维化,模拟人类NASH的二次打击。该模型动物产生明显肝脂肪变性,炎症反应,细胞凋亡(又叫肝细胞气球样变)及纤维化,所有这些病理变化都可以用人类NASH诊断标准作定量评价,并都吻合NASH的指标。我们已经确认纤维化、气球样变、炎症(在某种程度上)是高脂饲料和四氯化碳双重作用的结果,进一步说明了其与人类NASH病理的机制相似性。这一点与单纯HFD诱导的脂肪肝炎或CCL4诱导的肝纤维化及肝损伤形成鲜明对比。我们的模型已经用目前处于临床三期的INT-747(奥贝胆酸)作了充分的药效验证。INT-747的机制已经用生物标记物做了进一步的研究,即通过对该药的作用机制(MOA)相关的关键基因表达的定量。该模型已经用于测试其它NASH治疗药物,类似的生物标记物研究也验证各自的MOA。此外,我们也将该模型与作过比较。 这次我们邀请了药明康德生物部高级主任徐德鸣博士与大家进行在线交流,直接介绍有关的动物模型及动物实验的设计,分享该模型在测定新型治疗NASH化合物体内药效中的应用,比较用于NASH治疗药物的其它动物模型,对各类模型的特点进行对照。我们在研讨会最后设置了互动环节,如果您有任何问题,可以直接与徐博士及他的团队进行现场讨论。
修饰蛋白质组学研究思路及SCI文章解析
生物体中许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质的相关丰度控制,还会被各种时空特意分布、可逆的翻译后修饰调控,因此揭示翻译后修饰的发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。 蛋白质发生翻译后修饰时其分子质量会发生相应的改变,通过质谱能够精确测定蛋白质或多肽的分子质量。同时,发生翻译后修饰的蛋白质在样本中含量低且动态范围广,所以在质谱检测前需要对发生修饰的蛋白质或肽段进行富集。 本次课程中科新生命王文婕博士就“修饰蛋白质组学的研究思路及SCI文章解析”为题展开讨论,向大家介绍修饰蛋白质组学的技术方法及研究进展,以及在SCI文章中的实验设计思路。
单分子测序开启转录组学研究新时代
以基因测序技术发展为背景,阐述以第三代测序技术为核心的全长转录组测序与二代测序技术的转录组测序的差异,以及在研究基因结构等问题上所带来的巨大优势。并以经典案例为参考,阐述全长转录组测序在样品制备、实验设计及数据分析等环节的切入点和注意事项。
质谱代谢组学技术:精准医学的赋能者—Beyond biomarker, towards mechanism
众所周知,多组学(Multi-Omics)技术是精准医学研究的重要抓手之一,不同组学研究能为揭示疾病标志物与致病机制提供不同分子层次上的有益视角。有容乃大,众行则远,针对不同疾病的特性与研究需求,灵活调配各种组学技术,兼容并用,已然成为精准医学实践中自觉自发的一种研究模式,引人关注,蔚为大观。作为生物信息流传递的下游与遗传-暴露因素复杂互作级联效应的读取器,生物体液中富蕴的代谢组信息与生物表型之间存在着天然上的最大似然,代谢组学技术在既往的转化医学研究中呈现出的价值人所共知。正如学界倡议的那样直截了当,Metabolomics Enables Precision Medicine!此次,让我们一起回顾代谢组学与转化医学守望相助、风云激荡的过往,纵观技术的悄然进步如何成就精准医学更好的现下与将来。主要分享的内容有: • 以史为鉴,继往开来:代谢组学在精准医学中的应用与启示 • 盘马弯弓,引而待发:质谱代谢组学的技术体系与研究流程 • 西北望,射天狼:最新技术进展之从非靶向到靶向、从谱库到云端的全面出击 • 结语:了却客户烦心事
周大鹏:识别糖复合物的抗体在肿瘤和感染疾病中的转化医学研究
介绍了为什么研究糖复合物,提到了糖复合物的功能,抗体,介绍了糖复合物研究的新进展,抗体识别糖肽的共同规律
翻译后修饰组学分析的深度开发与应用
生命活动和疾病发生等不仅与蛋白质的表达丰度相关,与修饰也密切相关。翻译后修饰蛋白质组学有助于揭示生命活动的分子调控机制、生物标志物筛选及药物靶点鉴定等。 翻译后修饰是目前蛋白质组学领域的研究热点,与蛋白质组学相比,已有研究少,更具有新颖性! 其中质谱是鉴定蛋白质翻译后的重要方法,其原理是利用蛋白质发生修饰后的质量偏移来实现翻译后修饰位点的鉴定。 本次课程中科新生命严峻博士就“翻译后修饰组学分析的深度开发及应用”为题展开讨论,向大家介绍如何获得更多位点的验证。