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单细胞和空间转录中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

Cell Genomics:刘琦/严钢团队开发TCR和T细胞转录跨模态整合分析的AI框架——UniTCR

UniTCR提出了一种低质跨模态场景下的免疫组学有效整合和表征的AI框架,以赋能诸多免疫数字解码相关的下游任务分析。

2024-05-06

Nat Methods | 单细胞三维基因与基因表达联合分析:北京大学谢晓亮等团队揭示嗅觉受体选择的动态过程

该研究结果揭示了一个值得注意的模式:在OSN发展过程中,OR增强子的可及性降低,表明只有一部分增强子在成熟的OSN中保持活性。

2024-04-17

Nat Aging | 华中科技大学王世宣/栗妍/戴俊揭示人类卵巢衰老的时空转录变化及FOXP1的调控作用

该研究提出了一个时空图谱,系统地描述了在卵巢生命周期的三个代表性阶段人类卵巢衰老的空间原型和细胞异质性:生殖年轻(18-28岁),中年(36-39岁)和老年(47-49岁)。

2024-04-11

Nature biotechnology:单细胞生物是否能实现精准医疗的承诺?

随着单细胞技术在生物医学研究中的不断深入,其在临床诊断和预后中的应用也开始显现出巨大潜力。

2024-02-22

科研人员开发uCoTargetX技术实现单细胞多组蛋白修饰与转录并行检测

研究者在此基础上进一步优化革新,发展了uCoTargetX技术,在国际上率先实现单细胞多种组蛋白修饰和转录组的并行检测,为深入研究各种生理病理状态下细胞命运的表观调控提供了强有力的技术工具。

2024-01-16

【日程更新】第四届单细胞测序技术应用研讨会暨单细胞&空间研讨会诚邀您的参与!

“第四届单细胞测序技术应用研讨会暨单细胞&空间组学研讨会”将于2023年12月19-20日在中国·北京召开。

2023-12-06

应晓敏/伯晓晨团队开发基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组数据的马赛克整合

研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具——MIDAS,首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能。

2024-01-25

Sci Transl Med:科学家有望利用单细胞基因技术来加速人类肺部疾病药物的开发

来自德国的科学家们利用新型实验模型来研究肺部疾病,即所谓的人类精确切割肺部切片,这些是肺部组织的薄片,或能用于实验室的研究中。

2023-12-13

Cell:张鹏/周虎/季红斌/高大明团队合作绘制小细胞肺癌蛋白基因图谱

该研究是国际上首次大规模对小细胞肺癌临床队列开展蛋白质组和磷酸化蛋白质组表征。

2024-01-08