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Nat Commun:通过整合细胞形态和空间转录深度剖析肿瘤生态系统

METI是一种机器学习方法,它通过整合空间基因表达数据和病理学组织学特征,系统性地分析肿瘤生态系统。

2024-09-04

Dev Cell:余逸群/余洪猛/刘环海/任雯雯绘制嗅上皮衰老的单细胞转录图谱

该研究建立了哺乳动物嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱(图1),解析嗅上皮细胞类型特异性的衰老相关差异表达基因,发现衰老导致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是转录调控网络中的核心因子。

2024-08-27

Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录学分析

本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。

2024-06-20

大脑中的“园丁”与“杂草”Nature:利用空间转录时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应

这项研究表明,细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性,在塑造衰老过程中起着关键作用。

2024-12-27

科研人员开发基于深度学习模型的空间转录精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

Nature Genetics:任善成/谌科/古迪团队绘制首个成年人前列腺空间转录图谱,揭示前列腺新的生理功能和癌变机制

该研究构建了首个高分辨率成年人前列腺空间图谱,系统解析了前列腺的空间异质性与细胞组成。

2025-04-04

研究揭示海洋巨型单细胞多核钙化藻基因异源多倍化与生物钙化机制

针对仙掌藻和脆叉节藻的钙化模式的差异,该研究揭示了仙掌藻胞外钙化和脆叉节藻次级细胞壁钙化的遗传调控特征。

2024-10-04

Cell:利用蛋白质破解细胞表面的通信语言

Li和来自斯坦福大学和布罗德研究所的研究人员研究了神经元内teneurin激活后发生的信号传导。

2024-09-24

Nature:单细胞多组研究揭示唐氏综合征儿童易患白血病的原因

这项单细胞多组学研究为唐氏综合征胎儿造血提供了高分辨率分子图谱,并表明唐氏综合征患者细胞基因组中存在显著的调节重构,从而导致他们易患白血病等血液学疾病。

2024-10-03

Nat Methods:scNanoSeq-CUT&Tag技术:可精准检测单细胞基因复杂区域的染色质修饰

该研究开发了一种基于单分子测序平台的 scNanoSeq-CUT&Tag 新方法,可以精准检测单个细胞内染色质修饰特征,包括组蛋白修饰和转录因子的结合分布模式。

2024-10-12