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Nature Biotechnolog:绘制剪接调控的“GPS”!KATMAP如何精准区分剪接调控的直接与间接效应?

KATMAP的诞生,不仅仅是为我们提供了一个分析数据的新工具,它更代表了一种从海量转录组数据中萃取生物学智慧的新范式。

2025-11-09

Nature Biotechnology:绘制剪接调控的“GPS”——KATMAP如何精准区分剪接调控的直接与间接效应?

KATMAP是一种全新的可解释性回归模型,能够仅凭剪接因子敲低后的RNA-seq数据和该因子的结合序列偏好 (binding motif),就能精准推断出其活性、调控靶点,并清晰地区分直接与间接效应。

2025-11-08

Cell:让“DNA剪刀”变身“RNA手术刀”!可爱龙团队将Cas9及其祖先转变为RNA编辑器

该研究对 Cas9 的祖先 IscB 以及 Cas9 自身进行了工程化改造,删除了其 TID/PID 结构域,将它们从原本的 RNA 引导的 DNA 编辑器转换为 RNA 引导的 RNA 编辑器。

2025-08-19

Nature:没有这个微小RNA,所有的公鸡都得死

该研究发现了一种独特的鸟类性染色体剂量补偿系统——通过这一系统,一个 miRNA——miR-2954 成为雄性鸟类存活的必需因子。

2025-07-22

复旦大学发表RNA转录最新Nature论文

本发现揭示了 RNA 聚合酶 III(Pol III) 在高需求小 RNA 的 3 型启动子上的动态变化和重新启动机制的分子层面见解,其中包含了最早记录的 RNA 聚合酶的起始 - 延伸转变。

2025-06-06

Nature Genetics:变“在场”为“在岗”——基于剪接修复的活性筛选系统,重塑高分辨率碱基编辑扫描新范式

研究团队开发了一种基于“编辑活性”的共筛选方法,它如同一枚精准的“试金石”,能够特异性地富集那些编辑真正“在岗工作”的细胞,从而将筛选的信噪比提升到了一个全新的水平。

2025-10-21

Cell头条:迄今最古老RNA分子,开启猛犸象研究新视角

研究团队尝试将古 RNA 研究拓展至已灭绝动物的古转录组领域——以标志性物种长毛猛犸象为研究对象。

2025-11-17

Cell:将 IscB 和 Cas9 转换为 RNA 编辑器

该研究对 Cas9 的祖先 IscB 以及 Cas9 自身进行了工程化改造。

2025-08-24

Science:剪接体对RNA转录本的编辑延迟会导致细胞死亡

在这项新的研究中,这些作者如今发现了一种以更微妙的方式干扰剪接过程的机制。它与剪接体的一个由三种亚基U4、U5 和 U6组成的特定部分有关。

2024-11-28

Nature:特定RNA修饰或会促进自身免疫性疾病的发展

本文研究揭示了RNA糖基化在免疫逃逸和细胞凋亡后清除中的关键作用;通过一系列体内外实验,研究人员证明了N-糖链能掩盖RNA上的acp3U从而阻止其激活TLR3和TLR7。

2025-08-10