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Nature:阐明一种独特的DNA甲基化模型

3月28日,哈佛-麻省理工博德研究所的Alexander Meissner等人在Nature在线发表了一篇名为“A unique regulatory phase of DNA methylation in the early mammalian embryo”的文章,阐明了哺乳动物胚胎早期一种独特的DNA甲基化模型。 DNA甲基化是高度活跃于哺乳动物胚胎形成期。

2012-11-18

Genome Res:新方法让甲基化分析不再受限于材料

对于基因组水平的DNA甲基化研究,您有好几种方法可以选择,比如,全基因组亚硫酸氢盐测序。这种方法带来了高分辨率且全面的甲基化模式检测,但它需要大量的起始材料。在构建文库时,通常需要5μg以上的基因组DNA。因此,对于起始材料有限的样本,这种甲基化分析方法不适用。 相比之下,低代表性的亚硫酸氢盐测序需要的起始DNA要少一些,但同时牺牲了全面性。与分析整个基因组不同,这种方法聚焦于基因组的特定区域。

2012-11-19

JTO:非小细胞肺癌肿瘤组织和无肿瘤DNA的特殊突变或存在高度一致性

近日,刊登在国际杂志Journal of Thoracic Oncology上的刊登的一篇研究论文中,来自国外的研究人员通过研究发现,恶性非小细胞肺癌(NSCLC)患者血浆中循环的无肿瘤DNA(ctDNA)的表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变和病人肿瘤组织中的DNA的突变直接相关。

2014-08-31

Molecular Cell:科学家发现羟甲基化DNA的特异识别机制

科学家首次证实了UHRF2蛋白作为5hmC特异识别蛋白的存在(5hmC specific reader)。

2014-06-05

JBC:赖氨酸甲基化负调节IFITM3的抗病毒功能

SET7介导的第88位赖氨酸甲基化负调节宿主限制因子IFITM3的抗病毒功能。(A)串联亲和纯化策略。(B)IFITM3第88位赖氨酸单甲基化受VSV感染诱导并受干扰素α处理抑制。(C)IFITM3与SET7的内源性相互作用受VSV感染上调,并受干扰素α处理下调。(D)只有在IFTIM3表达存在下,基因沉默SET7才会影响VSV感染。

2013-10-21

比较远古与现代人的甲基化图谱

对远古DNA进行测序已经帮助科学家们了解将现代人与他们已灭绝的最近亲族尼安德特人与丹尼索瓦人分开的遗传改变;如今,据一项新的报告,科学家们也已经更好地理解了表观遗传学是如何影响这些群组之间的差异的。表观遗传学调控可改变基因的表达方式,但它并非通过改变基础的DNA序列,而是通过包括DNA甲基化等过程来影响基因的。

2014-04-22

Nature:修饰酶的顺序甲基化

RNA经历很多类型的转录后修饰。其中的一个类型是rRNA的2′-O-ribose的甲基化。修饰酶(box C/D核蛋白复合物)利用可识别两个甲基化点的guide RNA来识别其目标。 Teresa Carlomagno及同事确定了结合到基质RNA上的390 kDa archaeal复合物的结构。这项工作显示,两个“甲基化引导序列”存在于不同情境中,这种情况有利于在两个点上进行的顺序甲基化。

2013-10-24

MOL CELL:精氨酸的甲基化修饰参与调控细胞自噬的活性

2013年10月22日,张宏课题组在《Molecular Cell》杂志在线发表题为“Arginine Methylation Modulates Autophagic Degradation of PGL Granules in C.elegans”的论文。

2013-10-24

Nat Che Bio:胸腺嘧啶DNA糖基酶作用机制研究获进展

近日,国际著名杂志Nature Chemical Biology杂志刊登了来自芝加哥大学,中科院上海药物研究所等处的研究人员的最新研究成果“Thymine DNA glycosylase specifically recognizes 5-carboxylcytosine-modified DNA”,文章中,研究者在之前研究基础上,进一步探讨了人类胸腺嘧啶DNA糖基化酶的结晶结构,以及分子机制。

2012-11-18